有矛盾的协议不一定没有法律效力，其法律效力需根据具体情况来判断。以下从不同角度为你详细分析：

协议存在矛盾但不影响主要条款效力的情况

如果协议中的矛盾之处只是个别条款的表述存在歧义或者相互冲突，但这些矛盾并不影响协议主要条款的履行和协议目的的实现，那么该协议仍然具有法律效力。例如，在一个买卖合同中，关于交货时间的条款，一处写的是“本周五交货”，另一处写的是“下周一交货”，但合同中明确约定了交货地点、货物规格、价格等主要条款，且双方对主要条款没有争议。在这种情况下，虽然交货时间条款存在矛盾，但可以通过协商、按照交易习惯或者根据合同的其他条款来解释和确定交货时间，合同整体仍然有效。

协议存在矛盾且影响主要条款效力的情况

1. 矛盾导致协议无法履行或目的无法实现：如果协议中的矛盾使得协议的主要条款无法履行，或者导致协议的目的无法实现，那么该协议可能会被认定为无效或者部分无效。比如，在一个租赁合同中，关于租赁期限的条款，一处写的是“租赁期限为一年”，另一处写的是“租赁期限为三年”，且双方对租赁期限存在争议，无法达成一致意见。由于租赁期限是租赁合同的主要条款之一，这种矛盾可能会导致合同无法正常履行，甚至可能使合同的目的无法实现，此时合同可能会被认定为存在重大瑕疵，影响其法律效力。
2. 矛盾涉及违法违规内容：如果协议中的矛盾之处涉及到违法违规的内容，那么该协议不仅可能无效，相关方还可能面临法律责任。例如，一份协议中既约定了合法的交易内容，又约定了非法的内容（如走私、贩毒等），这种矛盾使得协议整体具有违法性，协议无效，且相关方可能因涉及违法犯罪行为而受到法律制裁。

协议存在矛盾时的处理方式

当发现协议存在矛盾时，双方可以首先尝试通过协商的方式来解决矛盾，对协议进行补充、修改或者重新签订。如果协商不成，可以寻求第三方调解或者通过仲裁、诉讼等法律途径来解决争议。在处理协议矛盾时，法院或者仲裁机构会根据协议的整体内容、双方的真实意思表示、交易习惯等因素来综合判断协议的效力以及如何解决矛盾。

建议：在签订协议时，双方应当仔细审查协议条款，确保条款表述清晰、准确，避免出现矛盾和歧义。如果对协议条款存在疑问或者不确定的地方，应当及时向对方提出并进行沟通和协商，以确保协议的有效性和可履行性。如果你在协议方面遇到相关问题，可以直接向我咨询。