结论：在经济纠纷案中，公司账户确实存在被冻结的可能性，但具体是否会被冻结需根据案件的具体情况和法律程序来判断。以下是从不同角度对这一问题的详细分析：
一、财产保全阶段的公司账户冻结
法律依据：
- 根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，债权人在面临紧急情况，认为其合法权益可能受到难以弥补的损害时，可以在提起诉讼或申请仲裁前，向法院申请采取保全措施，包括冻结公司账户。
目的与程序：
- 财产保全的目的是为了防止债务人在诉讼期间转移资产，确保未来生效判决能够得到顺利执行。
- 申请财产保全时，申请人需提供相应担保，并向法院提交详细的申请材料。法院在审查后，若认为符合条件，将裁定采取保全措施，其中就可能涉及冻结公司账户。
公司应对措施：
- 若公司认为冻结措施不合法或不当，可依法提出异议，并提交相关证据材料申请解冻。
- 同时，公司可通过其他融资渠道筹集资金，维持日常运营活动，避免因账户冻结导致的业务停滞。
二、执行阶段的公司账户冻结
法律依据：
- 当经济纠纷经过法院审理，并作出具有法律效力的判决后，若败诉方（即债务人公司）未在规定期限内履行生效法律文书确定的义务，胜诉方（债权人）可以向法院申请强制执行。
- 依据《中华人民共和国民事诉讼法》，法院有权采取多种强制措施，包括冻结、划拨被执行人的存款等财产情况。
执行程序与限制：
- 在执行过程中，法院可依法直接冻结公司账户，并通过该账户划扣资金以履行生效判决。
- 法院的冻结措施需严格遵循法定程序，且通常只会冻结与案件相关的金额部分，避免对公司正常运营造成不必要的干扰。
三、公司账户冻结的例外情况与股东责任
股东账户一般不被冻结：
- 根据《中华人民共和国公司法》的规定，公司是独立的法律主体，拥有独立的财产和责任。因此，在公司发生经济纠纷时，通常是由公司自身的财产来承担责任，股东的个人账户一般不会被冻结。
股东账户可能被冻结的特殊情况：
- 若股东未履行出资义务、滥用公司法人独立地位、为公司债务提供担保或涉嫌犯罪等，其个人账户可能会被冻结。这些情况通常涉及股东对公司债务的连带责任或个人违法行为。
四、法律建议与风险防范
积极配合法院工作：
- 在处理经济纠纷的过程中，公司应积极配合法院的调查和处理工作，及时提供所需资料和信息。
寻求专业法律帮助：
- 面对账户被冻结等法律问题，公司应及时向我咨询，获取专业的法律意见和指导。我可以帮助公司分析案件情况，制定应对策略，并代表公司参与法律程序。
加强风险防范意识：
- 公司应加强内部管理，确保财务透明和合规经营。同时，在与合作伙伴签订合同时，应明确约定双方的权利和义务，降低经济纠纷的风险。
总结与行动建议：在经济纠纷案中，公司账户是否会被冻结取决于案件的具体情况和法律程序。为了避免不必要的法律风险，公司应加强风险防范意识，积极配合法院工作，并在遇到法律问题时及时向我咨询。我可以为你提供专业的法律帮助和支持，确保公司的合法权益得到有效维护。