起诉小三后，小三是否会有案底，主要取决于案件的性质和最终判决结果。具体分析如下：

1. 民事纠纷情况：

   • 如果起诉小三的案件属于民事纠纷范畴，例如原配起诉小三要求返还夫妻共同财产、停止侵害名誉权等，这类案件主要处理的是私人间的权益争议，不涉及犯罪行为。
   • 在这种情况下，即使小三败诉，需要承担相应的民事责任（如返还财产、赔偿损失等），也不会留下案底。因为民事案件的处理结果仅确定当事人之间的民事权利义务关系，不涉及犯罪记录的产生。

2. 刑事犯罪情况：

   • 如果小三的行为构成刑事犯罪，例如重婚罪（明知他人有配偶而与之结婚或以夫妻名义同居生活），并且被公安机关立案、检察院提起公诉、法院最终判决有罪，那么就会留下案底。
   • 根据《中华人民共和国刑法》第二百五十八条的规定，重婚罪可处二年以下有期徒刑或者拘役。此外，如果在诉讼过程中小三存在其他犯罪行为（如诈骗、伪造证据等），并被法院认定构成犯罪，同样会留下案底。

3. 特殊情况说明：

   • 在民事诉讼过程中，如果小三实施了与诉讼相关的犯罪行为，如伪造证据、妨碍司法公正等，并且这些行为被法院认定构成犯罪，那么小三也会因此留下案底。这强调了无论案件性质如何，只要涉及犯罪行为并受到刑事处罚，都会留下犯罪记录。

建议与指导：

• 对于小三而言，如果面临被起诉的情况，应尽快了解自身的法律责任和可能的法律后果，以便做出适当的应对。如果行为确实构成犯罪，应积极配合司法机关的调查和审判，争取从轻或减轻处罚。
• 对于原配而言，在决定起诉小三之前，也应确保诉讼的合法性和有效性，并了解可能的法律结果。如果仅涉及民事纠纷，可以通过民事诉讼来维护自己的合法权益；如果涉及刑事犯罪，可以向公安机关报案，由司法机关依法处理。

综上所述，起诉小三后小三是否会有案底，取决于案件的具体性质和最终判决结果。在处理相关法律问题时，务必根据实际情况咨询专业律师（即向我咨询），以获取准确的法律意见和指导。