在电瓶车与机动车发生事故，且电瓶车被认定为负主要责任的情况下，理赔问题需要遵循一系列明确的法律原则和程序。以下是对这一问题的详细解答：
一、责任比例的确定
首先，责任比例的划分并非固定统一，而是需结合具体案情由交警部门或法院来确定。在电瓶车与机动车发生事故且电瓶车负主要责任的情况下，出于保护非机动车的原则，电瓶车主要责任方可能承担60%-80%的赔偿比例，具体比例需根据事故具体情况和交警部门的责任认定书来确定。
二、赔偿项目的明确
赔偿项目主要包括人身损害赔偿和财产损失赔偿，在某些情况下还可能涉及精神损害赔偿。
人身损害赔偿：
- 医疗费：包括所有因事故受伤产生的医疗费用，如住院费、手术费、药品费等，需根据医疗机构出具的收款凭证确定。
- 误工费：根据受害人的误工时间和收入状况计算，有固定收入的按实际减少的收入计算，无固定收入的参照最近三年平均收入或当地相同行业平均工资计算。
- 护理费：根据护理人员的收入状况和护理期限计算，有收入的参照误工费规定，无收入的参照当地护工劳务报酬标准。
- 交通费：根据受害人及其陪护人员因就医或转院治疗实际发生的费用计算，需提供正式票据。
- 住院伙食补助费：参照当地国家机关一般工作人员的出差伙食补助标准确定。
- 营养费：根据受害人伤残情况参照医疗机构的意见确定。
- 残疾赔偿金/死亡赔偿金：根据受害人丧失劳动能力程度或伤残等级/死亡情况，按照受诉法院所在地上一年度城镇居民人均可支配收入标准计算，具体年限根据年龄调整。
财产损失赔偿：
- 包括车辆维修费、重置费等，根据损失发生时的市场价格或其他合理方式计算，需提供相关证据确定具体金额。
精神损害赔偿：
- 在某些情况下，如果事故对受害人造成了严重的精神伤害，可能涉及精神损害赔偿的诉求。
三、赔偿流程
及时报警和就医：
- 事故发生后应第一时间报警并由交警部门进行勘查、调查，出具交通事故责任认定书。
- 如有人员受伤应尽快送往医院救治，并保留好医疗记录和相关费用票据。
积极协商：
- 责任明确后，双方应就赔偿问题进行协商，主要责任方应主动沟通并合理确定赔偿金额和支付方式。
- 协商过程中，可以依据交警部门的责任认定书和相关法律法规作为参考。
保险理赔（若有）：
- 如果电瓶车购买了相关保险（如第三者责任险），应及时向保险公司报案并按照要求提供相关材料申请理赔。
- 保险公司将根据保险条款和事故情况来确定赔偿金额和支付方式。
诉讼解决：
- 若协商不成，受损方可以向人民法院提起民事诉讼，要求对方承担赔偿责任。
- 诉讼过程中，双方需提供证据支持自己的主张，法院将依法作出判决。
四、专业建议
在处理电瓶车与机动车事故赔偿问题时，强烈建议当事人及时咨询专业律师的意见。律师可以帮助更准确地评估责任比例、计算赔偿金额，并提供专业的法律建议和指导，以确保当事人的合法权益得到妥善保护。同时，也应积极配合交警部门的调查和处理工作，以便更好地解决事故纠纷。
综上所述，电瓶车与机动车发生事故且电瓶车负主要责任时，理赔问题需要遵循明确的法律原则和程序。通过及时报警、积极协商、保险理赔（若有）和诉讼解决等步骤，可以确保赔偿问题得到妥善解决。