结论：医师开方开的是丸剂，诊所制丸是否合法需视具体情况而定，主要取决于诊所是否具备相应的资质和条件，以及制丸过程是否符合相关法律法规的规定。
分析：
资质与条件：
- 诊所若想要合法制丸，首先必须确保具备相应的药品生产或配制资质。这通常要求诊所符合《药品管理法》及相关实施条例中关于药品生产企业的基本要求，包括但不限于拥有符合标准的生产设施、设备、人员以及质量管理体系等。
- 如果诊所仅作为医疗机构提供医疗服务，而并未获得药品生产或配制的许可，那么其自行制丸可能构成违法行为。
制丸过程的合规性：
- 即便诊所具备相应的资质，制丸过程也必须严格遵守相关法律法规和药品生产质量管理规范（GMP）。这包括原料的采购、验收、储存，制丸工艺的制定、执行，以及成品的检验、放行等各个环节。
- 任何违反规定的行为，如使用不合格原料、未按照标准工艺制丸、未进行必要的检验等，都可能导致制丸行为的不合法。
特殊情况下的合法性：
- 在某些特殊情况下，如为了满足患者的特殊需求或进行临床试验等，诊所可能在获得相关监管部门批准后，进行有限度的药品配制或制丸。但这种情况通常受到严格的监管和限制。
建议：
- 如果诊所想要合法制丸，建议首先咨询当地药品监管部门或相关法律机构，了解具体的资质要求和审批流程。
- 在制丸过程中，务必严格遵守相关法律法规和药品生产质量管理规范，确保制丸行为的合法性和安全性。
- 如果患者对诊所制丸的合法性有疑问，可以向当地药品监管部门投诉或举报，以维护自己的合法权益。
法律后果：
- 如果诊所未经许可擅自制丸，可能面临药品监管部门的处罚，包括但不限于罚款、没收违法所得、吊销许可证等。
- 在严重情况下，如果制丸行为导致患者健康受损或死亡，诊所及其相关责任人员还可能承担刑事责任。
如有更多疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。