是的，刑事案件中被告人提交证据通常是在法庭调查阶段进行。以下是对这一问题的详细解释：
法庭调查阶段的作用
法庭调查阶段是刑事审判过程中的一个重要环节，其主要目的是通过双方当事人的举证、质证，查明案件事实，为后续的法庭辩论和判决奠定基础。在这个阶段，控辩双方都有机会向法庭提交证据，以支持自己的主张或反驳对方的主张。
被告人提交证据的具体流程
证据提交：在法庭调查阶段，被告人或其辩护人可以向法庭提交与案件相关的证据。这些证据可以是书证、物证、证人证言、鉴定意见等，旨在证明被告人的无罪或罪轻。
证据质证：提交证据后，控方（通常是检察院）有权对被告人提交的证据进行质证，提出质疑或反驳。被告人或其辩护人则有权对控方的质证进行回应和解释。
法庭认证：法庭在听取双方对证据的质证意见后，会对证据的真实性、合法性和关联性进行审查，并决定是否采纳该证据作为认定案件事实的依据。
被告人提交证据的注意事项
及时性：被告人或其辩护人应在法庭规定的期限内提交证据，逾期提交的证据可能不被法庭采纳。
相关性：提交的证据应与案件事实具有直接关联，能够证明被告人的无罪或罪轻。与案件无关的证据不会被法庭采纳。
合法性：提交的证据必须是通过合法手段取得的，非法取得的证据（如通过刑讯逼供、威胁、引诱、欺骗等方式取得的证据）不会被法庭采纳。
特殊情况下的证据提交
在某些特殊情况下，如被告人因客观原因无法在法庭调查阶段提交证据，或需要补充新的证据，可以向法庭申请延期审理或提供新的证据。法庭会根据具体情况决定是否准许。
法律后果
如果被告人未能在法庭调查阶段提交关键证据，可能导致法庭无法全面了解案件事实，从而影响判决结果。因此，被告人或其辩护人应充分重视法庭调查阶段的证据提交工作，确保所有有利于被告人的证据都能得到及时、有效的提交和质证。
总结来说，刑事案件中被告人提交证据通常是在法庭调查阶段进行。被告人或其辩护人应充分了解法庭调查阶段的流程和要求，确保所有有利于被告人的证据都能得到及时、有效的提交和质证。如果您在刑事案件中遇到任何法律问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。