同一公司的不同性质的往来，在特定条件下是可以合并处理的，但需严格遵循法定程序与规定。以下是对这一问题的详细分析：
一、合并的法律依据与可行性
法律依据：
- 根据《中华人民共和国公司法》，公司合并可以采取吸收合并或新设合并的方式。这为公司内部不同性质往来的合并提供了法律基础。
- 若涉及国有企业或外资企业，还需额外遵守《企业国有资产监督管理暂行条例》、《外商投资法》及相关实施细则等规定。
可行性：
- 不同性质的往来，如业务往来、资金往来等，在符合法律法规的前提下，可以通过合并协议进行整合，以优化资源配置、提高运营效率。
- 合并需确保各方权益得到妥善保护，避免损害债权人、股东或员工的利益。
二、合并的具体程序与要求
作出决议：
- 有限责任公司需经代表三分之二以上表决权的股东通过合并决议。
- 股份有限公司需经出席会议的股东所持表决权的三分之二以上通过。
- 国有独资公司的合并由国有资产监督管理机构决定。
- 外资企业还需按照外商投资相关法律法规履行审批或备案手续。
签订合并协议：
- 合并协议应明确合并各方的权利义务、资产处置、债务承担等事项，确保合并过程的透明与公正。
通知债权人：
- 自作出合并决议之日起十日内通知债权人，并在三十日内进行公告。
- 债权人可在规定期限内要求清偿债务或提供担保，以保障其合法权益。
资产评估与审计：
- 对合并各方的资产进行全面评估与审计，确保资产价值的真实性与合理性。
- 涉及国有资产时，必须按照国有资产评估的相关规定执行，防止资产流失。
人员安置：
- 妥善处理合并过程中的人员安置问题，包括劳动关系转移、薪酬福利调整、身份转换等。
- 避免因人员安置不当而引发劳动纠纷，确保合并过程的顺利进行。
办理登记：
- 合并完成后，依法向公司登记机关办理变更登记、注销登记或设立登记，以完成合并的法律手续。
三、特殊问题的处理
产权界定与评估：
- 清晰界定合并各方的产权归属，并按照相关规定进行合理评估。
- 防止资产流失或损害债权人利益，确保合并过程的合法性与公正性。
国有企业合并：
- 除遵循一般程序外，还需特别关注国有资产的保值增值、防止流失以及员工安置等敏感问题。
- 确保合并过程符合国有资产监管的相关规定，维护国家利益。
外资企业合并：
- 需遵守外商投资法律法规，履行相应的审批或备案手续。
- 确保合并后的企业继续符合外商投资企业的设立条件，维护外资企业的合法权益。
四、法律建议
- 提前规划：在合并前，应充分评估合并的可行性、法律风险及潜在收益，制定详细的合并计划。
- 专业咨询：寻求专业律师的帮助，确保合并过程的合法合规性，降低法律风险。
- 透明沟通：与债权人、股东及员工保持透明沟通，确保各方权益得到妥善保护，避免引发不必要的纠纷。
综上所述，同一公司的不同性质的往来在符合法律法规的前提下是可以合并处理的。但合并过程需严格遵循法定程序与要求，确保各方权益得到妥善保护。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。