当女职工在孕期遭遇公司破产的情况时，其合法权益确实应得到充分的保障。以下是对这一问题的详细解答，希望能为您提供清晰、全面的指导。

一、经济补偿金

法律依据： 根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位被依法宣告破产导致劳动合同终止的，应当向劳动者支付经济补偿金。这一规定同样适用于孕期的女职工。

计算标准：

1. 工作年限计算：经济补偿按劳动者在本单位工作的年限计算，每满一年支付一个月工资的标准。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，支付半个月工资的经济补偿。

2. 月工资定义：月工资是指劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资。若孕期女职工工作时间不足十二个月，则按照实际工作的月数计算平均工资。

3. 特殊情况处理：如果劳动者月工资高于用人单位所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资三倍的，经济补偿的标准将按职工月平均工资三倍的数额支付，且支付年限最高不超过十二年。

特殊保护： 孕期女职工在享受经济补偿金的同时，还享有其他特殊保护措施。例如，在孕期、产期、哺乳期内，用人单位不得依据《劳动合同法》的相关规定解除劳动合同。此外，在公司破产清算过程中，孕期女职工的经济补偿金属于破产财产中的职工债权部分，享有优先于普通债权的受偿权。

二、“三期”相关待遇

工资和生育津贴： 公司应支付孕期女职工至“三期”（孕期、产期、哺乳期）结束的工资和生育津贴。生育津贴通常按照女职工本人生育当月的缴费基数除以30再乘以产假天数计算。在公司破产的情况下，这部分费用可能需由公司承担，或者通过生育保险基金支付（如果女职工已参加生育保险且符合条件）。

医疗费用： 孕期女职工在孕期、产期发生的医疗费用，如果符合生育保险规定的项目和标准，且女职工已参加生育保险，则由生育保险基金支付。如果女职工未参加生育保险或不符合享受生育保险待遇的条件，相关费用可能需由公司承担。在公司破产时，未参保的女职工可以要求公司承担这部分费用。

三、补偿的优先顺序

根据《中华人民共和国企业破产法》的相关规定，破产财产在优先清偿破产费用和共益债务后，将按照以下顺序清偿：

1. 破产人所欠职工的工资、医疗、伤残补助、抚恤费用，以及应划入职工个人账户的基本养老保险、基本医疗保险费用和法律规定应支付给职工的补偿金。
2. 破产人欠缴的社会保险费用和税款。
3. 普通破产债权。

这意味着孕期女职工的工资、经济补偿等权益在破产清偿中具有较高的优先级。

四、维权建议

1. 及时申报债权：孕期女职工应密切关注公司破产清算的进程，及时向破产管理人申报债权，包括工资、经济补偿、“三期”待遇等，并提供相关证据以支持自己的主张。

2. 寻求帮助：可以向工会组织寻求帮助，由其代表与公司或破产管理人进行协商。同时，也可以申请法律援助，获得专业律师的支持和服务。

3. 法律途径维权：如果与公司或破产管理人无法达成一致意见，孕期女职工可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。对仲裁结果不服的，还可以向人民法院提起诉讼以维护自己的合法权益。

4. 协商解决方案：根据自身的实际情况（如孕期反应、身体状况及工作能力等），孕期女职工也可以与公司协商达成双方都能接受的补偿方案。

综上所述，孕期女职工在公司破产时享有充分的权益保障。希望以上解答能对您有所帮助，如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。