结论：醉驾案件若检察院决定不起诉，通常不会留下传统意义上的“案底”（即刑事犯罪记录），但可能会留下交通违法记录或行政违法记录，并可能面临其他行政处罚。

详细分析：

1. 不起诉的类型与后果：

   • 法定不起诉：若醉驾案件符合《刑事诉讼法》第十六条规定的情形，如情节显著轻微、危害不大等，检察院将作出不起诉决定。这种情况下，不会留下刑事犯罪记录，因为从法律层面不被认定构成犯罪。
   • 酌定不起诉：对于犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚的醉驾案件，检察院可以酌定不起诉。虽然本质上认定了犯罪行为，但基于情节轻微等原因决定不起诉。在一些地区，可能会留下违法记录，但这严格区别于经过法院判决有罪而产生的案底。通常情况下，开具无犯罪记录证明时是可以开具的。
   • 证据不足不起诉：若醉驾案件经过二次补充侦查后证据仍然不足，检察院应作出不起诉决定。这种情况下，没有充足证据认定犯罪嫌疑人构成犯罪，因此不会留下刑事犯罪记录。但若后续发现新证据且符合起诉条件，检察院可重新提起公诉，一旦被法院判定有罪，则会留下案底。

2. 其他影响：

   • 交通违法记录：即使检察院不起诉，醉驾行为本身违反了《道路交通安全法》，因此该行为仍可能被记录在交通违法记录中。这些记录在某些特定场合（如求职、申请某些许可证等）可能需要向相关部门披露。
   • 行政处罚：检察院的不起诉决定并不意味着对醉驾行为的纵容。在很多情况下，检察院或相关行政机关可能会根据具体情况和法律规定，对醉驾者采取其他行政处罚措施，如罚款、吊销驾驶证等。这些行政处罚记录会在公安机关留存，并在某些情况下（如申请驾照、求职等）被查询和考虑。

法律建议：

• 严格遵守交通法规：醉驾是极其危险且违法的行为，严重威胁道路交通安全和他人的生命财产安全。因此，强烈建议驾驶员严格遵守交通法规，坚决杜绝醉酒驾驶行为的发生。
• 了解法律后果：即使检察院决定不起诉，醉驾者仍可能面临交通违法记录和行政处罚。这些记录和处罚可能对个人未来的生活和工作产生一定影响。因此，在涉及醉驾问题时，应积极配合相关部门处理，并咨询专业律师以了解自身情况和可能面临的法律后果。

总结：醉驾案件若检察院决定不起诉，在大多数情况下不会留下刑事犯罪记录，但仍可能面临交通违法记录和其他行政处罚。无论如何，醉驾都是极其危险且违法的行为，应坚决杜绝。如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。