针对您提出的“醉驾检察院不起诉但是有罚金会留有案底吗”这一问题，以下是我为您提供的详细解答：

首先，我们需要明确“案底”的含义。在法律上，“案底”通常指的是一个人是否有犯罪记录。而醉驾是否留案底，与检察院是否起诉以及是否有罚金有直接关系。

1. 检察院不起诉的含义：

   • 当检察院对醉驾行为做出不起诉决定时，这通常意味着检察机关认为嫌疑人的行为虽然违法，但情节相对轻微，依法可以免于刑罚。
   • 依据《刑事诉讼法》的规定，这样的不起诉决定是不会被计入档案的，检察机关也不会对外公开此类信息。

2. 罚金与案底的关系：

   • 罚金是行政处罚的一种形式，它并不直接等同于刑事处罚。
   • 即使醉驾者被处以罚金，但只要检察院没有起诉，就不会形成刑事犯罪记录，即不会留下通常所说的“案底”。

3. 行政处罚的记录：

   • 虽然不起诉决定不会留案底，但醉驾行为本身属于违法行为，交管部门会对其进行行政处罚，如吊销驾照、5年内不得重新获取驾照等。
   • 这些行政处罚的记录是存在的，但它们并不等同于刑事犯罪记录，对个人的影响也相对较小。

4. 特殊情况下的影响：

   • 在某些特殊情境下，如申请某些职业资格证书、参与公务员招聘等，这些行政处罚记录可能会对个人产生一定影响。
   • 但总体来说，这种影响远小于刑事犯罪记录。

综上所述，对于醉驾检察院不起诉但是有罚金的情况，通常不会留有刑事犯罪记录（即案底）。但醉驾者仍需承担行政处罚的后果，并应深刻反思自己的行为，遵守法律法规，确保不再发生类似情况。