依申请公开的文件在符合相关法律法规规定，且不涉及国家秘密、法律禁止、危及安全稳定、商业秘密及个人隐私等限制条件下，是可以公开利用的。但具体是否公开利用，需由行政机关根据实际情况进行判断和处理。以下是对这一问题的详细分析：
可以公开利用的情况与条件
属于公开范围且不涉及保密等限制：
- 根据《中华人民共和国政府信息公开条例》，除主动公开的政府信息外，公民、法人或其他组织可向行政机关申请获取相关政府信息。若申请信息属于应公开范畴，且不含国家秘密、商业秘密、个人隐私等敏感内容，行政机关应予公开。例如，环保组织申请公开河流污染治理项目的环境影响评估报告，该报告不涉及敏感信息，行政机关应依法公开，此时该报告可以被公开利用。
经权利人同意公开：
- 若申请信息涉及商业秘密或个人隐私，但经相关权利人书面同意，行政机关可予以公开。例如，在旧城区改造项目中，若被征收居民同意公开其补偿安置协议，行政机关可根据申请向申请人公开，此时该协议可以被公开利用。
不可以公开利用的情况与原因
涉及国家秘密：
- 根据《中华人民共和国保守国家秘密法》，涉及国家秘密的文件不得公开。若依申请公开的文件包含国家秘密，无论以何种方式获取或传播，均属违法行为，将面临包括但不限于刑事责任在内的严厉法律制裁。例如，国防科研项目相关资料和数据属于国家秘密，申请公开将被依法拒绝，更不能公开利用。
涉及商业秘密：
- 商业秘密受《中华人民共和国民法典》《中华人民共和国反不正当竞争法》等法律法规保护。公开可能损害第三方商业利益的信息不予公开。例如，企业提交的独特生产工艺技术资料属于商业秘密，申请公开将被拒绝，也不能公开利用。
涉及个人隐私：
- 个人隐私受法律保护，未经本人同意，涉及个人隐私的信息不得公开。例如，个人医疗记录涉及隐私，未经本人同意，相关机构不会公开，也不能被公开利用。
其他法定不公开情形：
- 包括法律、行政法规禁止公开的信息，以及公开后可能危及国家安全、公共安全、经济安全、社会稳定的政府信息，还有行政机关的内部事务信息等。这些信息同样不能被公开利用。
公开利用的程序与要求
- 申请程序：若希望公开利用依申请公开的文件，需向行政机关的政府信息公开工作机构提出书面申请，并提供相关信息以便查询。
- 审查与处理：行政机关收到申请后，应进行审查，并在规定时间内作出是否公开的决定。决定应基于法律法规和实际情况，确保公开信息的合法性和合理性。若决定公开，还需明确公开利用的方式和范围。
法律后果与风险提示
- 若未经许可擅自公开利用涉及国家秘密、商业秘密或个人隐私的文件，将面临法律责任，包括但不限于民事赔偿、行政处罚甚至刑事责任。
- 即使文件属于可公开范畴，但在公开利用过程中若违反相关法律法规或行政机关的具体要求，也可能面临法律风险。
总结来说，依申请公开的文件能否公开利用，需综合考虑法律法规、信息性质、权利人意愿以及公共利益等多方面因素。在申请公开利用前，建议仔细审查文件内容，确保不违反任何法律规定和保密要求。若对具体问题存在疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。