结论：办理营业执照后，若因店铺存在分隔情况而不被批准，这通常与店铺的实际经营场所是否符合相关法规要求有关。具体来说，可能涉及店铺的布局、消防安全、卫生条件等多个方面。下面我将从不同角度为您详细分析。

1. 店铺布局与规划要求

• 法规依据：根据《中华人民共和国公司法》及相关商业登记法规，办理营业执照时，需要提供符合规定的经营场所证明。这通常意味着经营场所需要满足一定的布局和规划要求，以确保其适合进行商业活动。
• 分隔问题：如果店铺内部存在过多的分隔，可能会影响店铺的整体布局和规划，使得某些区域无法有效利用或不符合商业活动的需求。例如，过多的分隔可能导致消防通道不畅、顾客流动受阻等问题，从而影响店铺的合法性和安全性。
• 建议：在办理营业执照前，建议对店铺进行合理的布局和规划，确保分隔合理且不影响整体经营。如果已经存在分隔问题，可以考虑进行改造或调整，以满足相关法规要求。

2. 消防安全要求

• 法规依据：根据《中华人民共和国消防法》及相关消防安全规定，商业场所需要满足一定的消防安全要求，包括消防通道的畅通、消防设施的配备等。
• 分隔影响：店铺内部的分隔可能会影响消防通道的畅通性，增加火灾等安全事故的风险。如果分隔不合理或存在安全隐患，消防部门可能会要求进行整改或不予批准营业执照。
• 建议：在办理营业执照前，务必确保店铺的消防安全符合相关法规要求。如果存在分隔问题，应立即进行整改，确保消防通道畅通无阻，并配备必要的消防设施。

3. 卫生条件要求

• 法规依据：根据《中华人民共和国食品安全法》及相关卫生法规，商业场所（特别是涉及食品销售的场所）需要满足一定的卫生条件要求，包括环境整洁、设备清洁等。
• 分隔影响：店铺内部的分隔可能会影响卫生条件的保持。例如，过多的分隔可能导致清洁难度增加，容易滋生细菌等卫生问题。如果卫生条件不达标，相关部门可能会要求进行整改或不予批准营业执照。
• 建议：在办理营业执照前，应确保店铺的卫生条件符合相关法规要求。如果存在分隔问题，应考虑进行改造或调整，以便于清洁和维护卫生条件。

4. 其他可能的影响因素

• 城市规划与用途：店铺所在区域的城市规划和用途也可能影响营业执照的办理。如果店铺所在区域被规划为其他用途（如住宅区、绿化区等），则可能无法办理商业营业执照。
• 相邻关系：店铺与相邻建筑或场所的关系也可能影响营业执照的办理。例如，如果店铺与相邻建筑存在纠纷或影响相邻建筑的正常使用，则可能面临办理营业执照的困难。

后续行动建议：

• 咨询当地部门：建议您首先咨询当地的市场监管部门或相关政府部门，了解具体的法规要求和办理流程。
• 整改与调整：如果店铺存在分隔问题或其他不符合法规要求的情况，应立即进行整改和调整，以满足相关法规要求。
• 寻求专业帮助：如果您在整改和调整过程中遇到困难或疑问，可以寻求专业律师或相关机构的帮助，以确保您的权益得到保障。

如有任何进一步的问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。