校车在高速公路上超速40%，将面临驾驶证记12分，并处500元以上2000元以下罚款的处罚。具体分析如下：

1. 记分规定：

   • 根据《道路交通安全违法行为记分管理办法》第八条，驾驶校车在高速公路、城市快速路上行驶超过规定时速百分之二十以上，或者驾驶其他机动车在高速公路、城市快速路上行驶超过规定时速百分之五十以上的，一次记12分。校车超速40%，显然超过了规定时速的20%，因此将面临记12分的处罚。

2. 罚款规定：

   • 根据《中华人民共和国道路交通安全法》第九十九条，机动车行驶超过规定时速百分之五十的，由公安机关交通管理部门处二百元以上二千元以下罚款。虽然校车超速40%未直接达到50%，但此条款提供了一个罚款的幅度范围。在实际执法中，对于校车这类特殊车辆，超速行为往往会被视为严重违法行为，因此罚款可能会接近或达到该幅度的上限。同时，部分地方性法规可能对校车超速有更为具体的罚款规定，如《山东省高速公路交通安全条例》第五十五条就规定，驾驶校车在高速公路上行驶超过规定时速百分之二十以上未达百分之五十的，处五百元罚款。

3. 其他后果：

   • 除了记分和罚款外，校车驾驶人还可能面临其他后果。例如，根据《校车安全管理条例》第五十条，校车驾驶人违反道路交通安全法律法规的，由公安机关交通管理部门依法从重处罚。这意味着，在同等超速情况下，校车驾驶人可能会受到比普通机动车驾驶人更严厉的处罚。此外，校车驾驶人还可能因记分达到12分而被扣留驾驶证，需要参加满分学习、考试，甚至可能面临驾驶证被吊销的风险。

建议：作为校车驾驶人，应严格遵守道路交通安全法律法规，确保行车安全。如果因超速等违法行为受到处罚，应及时处理并吸取教训，避免再次发生类似行为。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。