结论：离婚后财产分割协议约定的公司股权未变更，一般不受3年诉讼时效的限制，但需根据具体情况判断是否存在诉讼时效的适用问题。

分析说明：

1. 诉讼时效的基本概念：

   • 诉讼时效是指民事权利受到侵害的权利人在法定的时效期间内不行使权利，当时效期间届满时，债务人获得诉讼时效抗辩权。在法律规定的诉讼时效期间内，权利人提出请求的，人民法院就强制义务人履行所承担的义务。而在法定的诉讼时效期间届满之后，权利人行使请求权的，人民法院就不再予以保护。

2. 离婚后财产分割协议的性质：

   • 离婚后财产分割协议是双方就离婚后财产的分配达成的协议，其性质属于民事合同。对于此类协议，如果一方未按照约定履行义务，另一方有权要求其履行或寻求法律救济。

3. 股权变更与诉讼时效的关系：

   • 股权变更本身是一个物权变动行为，其完成需要办理相关的工商变更登记手续。如果离婚后财产分割协议中约定了股权的变更，但一方未履行变更义务，这并不直接构成对另一方权利的侵害（在协议有效且未被撤销或宣告无效的前提下），而是构成了对协议约定的违反。
   • 在这种情况下，另一方要求履行股权变更的请求，通常不受诉讼时效的限制，因为股权变更的请求权并非基于侵权行为产生的债权请求权，而是基于合同产生的物权变动请求权。然而，如果另一方选择通过诉讼方式要求对方承担违约责任（如赔偿损失等），则可能受到诉讼时效的限制，具体取决于违约行为的性质和法律规定。

4. 特殊情况下的诉讼时效问题：

   • 如果离婚后财产分割协议存在无效或可撤销的情形（如欺诈、胁迫等），且一方在法定期间内未行使撤销权或确认无效的权利，则可能因超过诉讼时效而丧失相关救济途径。但这种情况与股权变更本身是否受诉讼时效限制无直接关联。
   • 另外，如果股权变更涉及第三方利益（如公司其他股东的优先购买权等），则可能因涉及多方利益而需要综合考虑相关法律规定和诉讼时效问题。

法律建议：

• 如果您面临离婚后财产分割协议约定的公司股权未变更的情况，首先应检查协议的有效性及是否存在可撤销或无效的情形。
• 如果协议有效且未被撤销或宣告无效，您可以要求对方履行股权变更义务，并考虑通过法律途径（如诉讼或仲裁）来维护自己的权益。在此过程中，一般无需过分担心诉讼时效的问题，但应尽快行动以避免潜在的法律风险。
• 如果您对协议的有效性或履行情况存在疑问，或者担心可能涉及诉讼时效的问题，建议及时咨询专业律师以获取更具体的法律建议。

可能后果：

• 如果您及时采取行动要求对方履行股权变更义务，并成功办理了相关手续，则您的权益将得到有效保障。
• 如果您因拖延或未采取适当行动而导致超过诉讼时效（在涉及违约责任等债权请求权的情况下），则可能面临无法通过法律途径追究对方责任的风险。但请注意，这并不影响您要求对方履行股权变更义务本身（在协议有效且未被撤销或宣告无效的前提下）。