您好，关于离职证明是否需要放入档案里，这个问题其实并没有一个绝对的答案，因为它可能因地区、单位以及具体的管理规定而有所不同。不过，我可以根据一般情况和常见做法，给您一些详细的解释和建议。

首先，离职证明是员工与原单位解除劳动关系的重要凭证，它记录了员工的工作经历、离职原因以及离职时间等关键信息。在很多情况下，这份证明对于员工未来的职业发展、社保转移、公积金提取等都有着重要的作用。

关于是否需要放入档案：

1. 一般情况：在大多数情况下，离职证明并不需要直接放入个人的人事档案中。人事档案通常包含的是员工的基本信息、学历证明、工作经历（但更侧重于职务晋升、奖惩记录等）、社保记录等核心内容。离职证明虽然重要，但更多是作为员工个人职业发展过程中的一个辅助性文件。

2. 特殊情况：然而，也有一些单位或地区可能要求将离职证明作为档案的一部分进行归档。这通常是为了确保员工工作经历的完整性和连续性，便于未来进行背景调查或审核。此外，如果您计划申请某些特定的职业资格认证、出国深造或移民等，相关机构可能也会要求您提供离职证明作为证明材料之一。

3. 实际操作建议：

   • 保留原件：无论离职证明是否需要放入档案，您都应该妥善保管好原件。因为未来在办理社保转移、公积金提取、入职新单位等手续时，都可能需要提供离职证明。
   • 咨询新单位：在入职新单位时，您可以主动咨询新单位的人事部门或相关负责人，了解他们对于离职证明的具体要求。如果新单位要求提供离职证明作为档案的一部分，您可以根据要求进行提供。
   • 了解地区规定：不同地区对于档案管理的规定可能有所不同。如果您对于当地的具体规定不太清楚，可以咨询当地的人力资源和社会保障部门或相关机构进行了解。

针对您提到的具体问题：

如果您的新单位在查看档案时发现缺少第一家公司的离职证明，并要求您提供原件，但原件在第二家的入职资料里且第二家公司拒绝提供，这确实是一个比较棘手的问题。在这种情况下，我建议您：

• 首先与第二家公司进行沟通，说明情况并请求他们提供离职证明的复印件或加盖公章的证明文件（如果允许的话）。
• 如果第二家公司仍然拒绝提供，您可以考虑向当地的人力资源和社会保障部门或劳动监察部门寻求帮助，了解是否有其他途径可以获取离职证明或解决这个问题。
• 同时，您也可以与新单位进行沟通，说明情况并询问他们是否可以接受其他形式的证明文件（如工作经历证明、社保缴纳记录等）作为替代。

希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。