原配一般不能直接起诉怀孕的小三，但可以根据具体情况，通过法律途径维护自身权益。以下是对此问题的详细分析：
一、直接起诉小三的法律障碍
缺乏直接法律依据：
- 在我国法律体系中，没有直接针对“小三”的法律规定，因此原配无法以“小三破坏婚姻”为由直接提起诉讼。
- 怀孕本身并不构成违法行为，除非存在重婚或与他人同居等法定过错情形。
证据收集难度：
- 要证明配偶与小三存在不正当关系，需要确凿的证据，如亲密照片、视频、聊天记录等。
- 这些证据的收集往往涉及侵犯他人隐私，可能引发法律风险，且在实际操作中难度较大。
二、可采取的间接法律措施
追究配偶责任：
- 若配偶在婚姻关系存续期间与他人同居或重婚，原配可依据《民法典》第一千零九十一条提起离婚诉讼，并要求损害赔偿。
- 需提供配偶与第三者持续稳定共同生活的证据，如租房合同、小区物业证明、证人证言等，以证明配偶存在过错。
财产权益保护：
- 若配偶擅自将夫妻共同财产赠予小三，原配可通过诉讼主张返还。根据《民法典》第一百五十三条，违背公序良俗的赠与行为无效。
- 需提供转账记录、消费凭证等证据，证明配偶未经同意处分共有财产，从而要求小三返还受赠的财物。
刑事自诉途径：
- 若配偶与小三以夫妻名义共同生活构成重婚罪，原配可向法院提起刑事自诉。
- 需提交结婚证、户籍登记资料、证人证言等形成完整证据链，以证明配偶与小三存在重婚行为，从而追究他们的刑事责任。
三、针对小三怀孕的特殊情况
- 虽然小三怀孕本身不直接构成原配起诉的法律依据，但如果能够证明小三与配偶存在重婚或同居关系，且这种关系对原配造成了精神损害或财产损失，原配仍然可以通过上述间接法律措施来维护自己的权益。
- 例如，如果小三怀孕是由于与配偶的非法同居行为导致的，原配可以收集相关证据，如医疗记录、证人证言等，来证明配偶与小三的同居关系，并据此提起离婚诉讼或要求损害赔偿。
四、实际操作中的建议
注重证据收集：
- 无论采取何种法律途径，证据的收集都至关重要。原配应尽可能收集相关证据，如聊天记录、转账记录、亲子鉴定结果（如适用）、证人证言等，以支持自己的诉讼请求。
保护自身权益：
- 在整个过程中，原配应时刻关注自己的合法权益和隐私安全，避免受到进一步的伤害。例如，在收集证据时，应确保不侵犯他人的合法权益；在提起诉讼时，应选择合适的法律途径和策略。
寻求法律帮助：
- 如果你作为原配，在面对这类复杂问题时感到困惑或无助，可以直接向我咨询。我会根据你的具体情况，为你提供专业的法律建议和帮助。
综上所述，原配在面对小三怀孕的情况时，虽然不能直接起诉小三，但可以根据具体情况通过法律途径维护自己的合法权益。在处理这类问题时，建议注重证据的收集和整理，以及保护自身的权益和隐私安全。