分包单位在总包单位没有施工许可证的情况下，一般有权停止施工，但具体需结合合同约定和实际情况判断。以下从不同角度进行分析：
一、法律层面
施工许可证的法定性：
- 根据《中华人民共和国建筑法》及相关规定，建筑工程开工前，建设单位应当按照国家有关规定向工程所在地县级以上人民政府建设行政主管部门申请领取施工许可证。这是建筑工程合法开工的必要条件。
分包单位的权利：
- 如果总包单位未取得施工许可证而擅自施工，这属于违法行为。分包单位作为施工活动的参与者，有权拒绝参与违法施工活动，以保护自身合法权益并避免潜在的法律风险。
二、合同层面
合同约定：
- 分包合同中通常会明确约定施工的前提条件，包括施工许可证的取得。如果合同中明确规定了总包单位需取得施工许可证后分包单位方可施工，那么在总包单位未取得施工许可证的情况下，分包单位有权依据合同约定停止施工。
违约责任：
- 如果总包单位未取得施工许可证而要求分包单位施工，这可能构成违约行为。分包单位有权要求总包单位承担违约责任，并有权选择停止施工以避免损失扩大。
三、实际操作层面
沟通协商：
- 在发现总包单位未取得施工许可证时，分包单位应首先与总包单位进行沟通协商，了解未取得施工许可证的原因及预计取得时间。如果总包单位能够给出合理的解释并承诺尽快取得施工许可证，分包单位可以考虑继续施工，但应要求总包单位承担因此产生的额外费用和风险。
停止施工的决定：
- 如果总包单位无法给出合理解释或承诺，或者分包单位认为继续施工将面临较大的法律风险和经济损失，那么分包单位有权决定停止施工。在停止施工前，分包单位应通知总包单位并说明停止施工的原因和依据。
后续处理：
- 停止施工后，分包单位应与总包单位协商解决后续事宜，包括已施工部分的验收、结算以及未施工部分的合同解除或变更等。如果协商无果，分包单位可以通过法律途径维护自身权益。
四、风险提示
- 分包单位在停止施工前应确保自身行为符合合同约定和法律规定，避免因擅自停止施工而承担违约责任或面临其他法律风险。
- 分包单位在停止施工后应积极与总包单位沟通协商，寻求妥善解决方案，以减少损失并维护双方合作关系。
总结来说，分包单位在总包单位没有施工许可证的情况下，一般有权停止施工。但具体是否停止施工以及后续如何处理，需结合合同约定、实际情况以及双方沟通协商的结果来判断。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。