结论：在专利代理合同失效的情况下，选择按《民法典》第157条还是第1165条起诉，以及是否可以主张侵权责任，需根据合同失效的具体原因和后果来综合判断。以下是对此问题的详细分析：
一、合同失效的法律条款适用
《民法典》第157条：
- 适用情形：该条款主要规定的是民事法律行为无效、被撤销或者确定不发生效力后的法律后果，包括返还财产、折价补偿以及赔偿损失等。若专利代理合同因违反法律、行政法规的强制性规定，或违背公序良俗等原因而无效，或者合同被撤销，或者确定不发生效力，则可适用此条款。
- 法律后果：根据该条款，合同无效或被撤销后，因该合同取得的财产，应当予以返还；不能返还或者没有必要返还的，应当折价补偿。有过错的一方应当赔偿对方由此所受到的损失；各方都有过错的，应当各自承担相应的责任。
《民法典》第1165条：
- 适用情形：该条款规定的是过错责任原则，即行为人因过错侵害他人民事权益造成损害的，应当承担侵权责任。若专利代理合同的失效是由于一方或双方的过错行为（如欺诈、胁迫、恶意串通等）导致的，且该过错行为同时构成了对另一方权益的侵害，则可能同时涉及侵权责任，此时可考虑适用此条款。
- 法律后果：根据该条款，过错方需承担侵权责任，包括停止侵害、排除妨碍、消除危险、返还财产、恢复原状、赔偿损失等。
二、是否可以主张侵权责任
- 可以主张的情形：若专利代理合同的失效是由于一方的过错行为（如故意隐瞒重要信息、提供虚假资料等）导致的，且该过错行为同时构成了对另一方专利权或其他合法权益的侵害，那么受损方可以主张侵权责任。
- 不可主张的情形：若合同失效是由于不可抗力、双方无过错或合同本身存在瑕疵（如条款不明确、违反法律法规等）但并未构成对另一方权益的直接侵害，则一般难以主张侵权责任。
三、综合建议
- 分析合同失效原因：首先，需要详细分析专利代理合同失效的具体原因，包括是否违反法律法规、是否存在欺诈或胁迫等情形，以及双方是否存在过错等。
- 选择适用法律条款：根据合同失效的原因和后果，选择适用《民法典》第157条或第1165条，或者同时适用两条款（如合同无效且存在侵权行为时）。
- 收集证据并起诉：在决定起诉后，需要收集相关证据以支持自己的主张，包括合同文本、交易记录、沟通记录、专家意见等。然后，根据选择的法律条款和收集的证据，向法院提起诉讼。
四、注意事项
- 在处理此类纠纷时，建议咨询专业律师以获取更具体的法律建议和指导。
- 诉讼过程中需注意证据的充分性和合法性，以及诉讼时效等问题。
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