结论前置：员工在多种情况下可以申请劳动仲裁来维护自己的合法权益，这些情况主要围绕劳动合同的订立、履行、变更、解除和终止，以及劳动报酬、工作时间、休息休假、社会保险等方面产生的争议。以下是对这些情形的详细梳理：
确认劳动关系争议：
- 当员工与用人单位对于是否存在劳动关系、劳动关系的起始或终止时间等方面存在分歧时，如未订立书面劳动合同但已形成事实劳动关系后发生的纠纷，员工可以申请劳动仲裁。
劳动合同相关争议：
- 订立：若用人单位以不合理条件要求签订劳动合同，或拒绝签订书面合同，员工有权申请仲裁。
- 履行：用人单位不按照合同约定提供劳动条件、支付劳动报酬，如随意变更工作岗位、未按时足额发放工资等，员工可以申请仲裁。
- 变更：用人单位未经劳动者同意擅自变更劳动合同关键条款，如工作地点大幅变动，员工同样可以申请仲裁。
- 解除和终止：用人单位违法解除劳动合同，如随意辞退无过错员工；或在劳动合同终止方面存在争议，如到期后不续签且未依法支付经济补偿，员工均可申请仲裁。
除名、辞退和辞职、离职争议：
- 用人单位不合理地对劳动者进行除名、辞退；劳动者依法辞职但用人单位设置障碍，或在离职手续办理、经济补偿等方面存在纠纷，员工可以申请仲裁。
工作时间、休息休假、社会保险等争议：
- 工作时间：安排超时加班且不支付加班费，员工可以申请仲裁。
- 休息休假：剥夺法定带薪年假、病假等休假权利，或调休安排不合理，员工同样有权申请仲裁。
- 社会保险：未依法缴纳社会保险，包括养老保险、医疗保险、失业保险、工伤保险和生育保险，员工可以申请仲裁以维护自己的社保权益。
- 福利：不按规定发放防暑降温费、取暖费等福利待遇，员工也可以申请仲裁。
- 劳动保护：未提供符合国家规定的劳动安全卫生条件和必要的劳动防护用品，员工同样可以申请仲裁。
劳动报酬、工伤医疗费、经济补偿等争议：
- 劳动报酬：克扣、拖欠工资，包括奖金、津贴、补贴等，员工可以申请仲裁以追讨欠薪。
- 工伤医疗费：拒绝支付工伤治疗费用，或对工伤认定及赔偿标准有争议，员工可以申请仲裁以获得应有的工伤赔偿。
- 经济补偿：劳动合同解除或终止时，拒绝支付或计算标准有争议的经济补偿，员工可以申请仲裁以维护自己的经济利益。
- 赔偿金：因用人单位违法行为给劳动者造成损害，需支付赔偿金但双方有分歧，员工同样可以申请仲裁。
其他特定情形：
- 解除或终止劳动关系后，请求返还劳动合同定金、保证金、抵押金等，或办理人事档案、社会保险关系移转手续发生的纠纷，员工可以申请仲裁。
- 劳动者退休后，与未参加社会保险统筹的原用人单位因追索养老金、医疗费等社会保险待遇发生的纠纷，员工同样可以申请仲裁。
- 因工伤、职业病请求给予工伤保险待遇的纠纷，以及依据劳动合同法第八十五条规定要求支付加付赔偿金的纠纷，员工也有权申请仲裁。
- 因企业自主改制发生的纠纷，员工同样可以通过劳动仲裁来维护自己的权益。
申请劳动仲裁的注意事项：
- 时效限制：员工应当在知道或应当知道其权利被侵害之日起一年内提出仲裁申请，除非遇到不可抗力或有其他正当理由。
- 申请材料：员工需要提交书面仲裁申请书，并按被申请人数提交副本。申请书中应详细载明劳动者的基本信息、用人单位的基本信息、仲裁请求及所依据的事实和理由、证据及来源、证人姓名及住所等信息。
作为程翠红律师，我建议员工在遇到上述情况时，及时收集相关证据，并咨询专业律师（即我本人）以了解具体的仲裁流程和注意事项，以便更好地维护自己的合法权益。