核心结论：项目出现安全事故后安全员被扣工资是否合理合法，需分情况判断，若用人单位扣工资行为不合法，安全员可通过协商、投诉、仲裁或诉讼等途径维权。以下是具体分析：

从扣工资合法性角度分析

1. 若用人单位扣工资行为合法
   • 依据法律规定：根据《工资支付暂行规定》第十六条，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若安全员在安全事故中存在重大过失或故意行为，导致项目出现安全事故并给用人单位造成了经济损失，且劳动合同中有相关赔偿约定，同时扣除工资未超过上述比例限制，那么用人单位扣工资的行为在一定程度上是合法的。
   • 举例说明：比如安全员明知某项操作存在严重安全隐患，却未按照规定进行制止和纠正，最终导致安全事故发生，给公司造成了直接经济损失10万元。若劳动合同中明确约定此类情况安全员需承担一定比例的赔偿责任，且公司每月扣除其工资未超过当月工资的20%，这种情况下扣工资就是合法的。
2. 若用人单位扣工资行为不合法
   • 无合法依据扣除：如果安全事故的发生并非安全员的过错导致，或者用人单位无法证明安全员存在故意或重大过失行为，那么用人单位以安全事故为由扣除安全员工资就没有合法依据。例如，安全事故是由于不可抗力因素（如地震、洪水等自然灾害）或者第三方故意破坏等原因造成的，与安全员的工作并无直接关联，此时用人单位扣工资就是不合法的。
   • 扣除比例超限：即使安全员对安全事故负有一定责任，但用人单位扣除工资的比例超过了当月工资的20%，这种扣除行为也是不合法的。比如安全员当月工资为5000元，公司一次性扣除其3000元作为安全事故的赔偿，这就超过了20%的比例限制。
   • 未履行告知义务：用人单位在扣除工资前，未按照法律规定将扣除的原因、依据和金额等事项书面告知安全员，这种扣除行为同样不合法。

从维权途径角度分析

1. 与用人单位协商
   • 操作方式：安全员可以先与用人单位进行友好协商，向用人单位说明自己对于安全事故的责任情况以及扣工资行为合法性的看法，要求用人单位停止不合理的扣工资行为，并补发被扣除的工资。
   • 优势：协商是一种较为温和、便捷的解决方式，可以避免双方关系进一步恶化，同时也有可能快速解决问题，节省时间和精力。
2. 向劳动监察部门投诉
   • 操作方式：如果协商无果，安全员可以向当地劳动监察部门投诉。投诉时需要准备好相关的证据材料，如劳动合同、工资条、安全事故报告、与用人单位沟通的记录等，以证明用人单位扣工资的行为不合法。劳动监察部门会对投诉进行调查核实，并依法责令用人单位改正。
   • 优势：劳动监察部门具有行政执法权，能够对用人单位的违法行为进行查处，具有较强的威慑力，能够促使用人单位尽快解决问题。
3. 申请劳动仲裁
   • 操作方式：安全员还可以向劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁。在申请仲裁时，需要提交仲裁申请书、相关证据材料等。仲裁委员会会根据双方提供的证据和陈述进行审理，并作出裁决。
   • 优势：劳动仲裁是一种具有法律效力的解决劳动争议的方式，仲裁裁决具有强制执行力，如果用人单位不履行裁决，安全员可以向人民法院申请强制执行。
4. 提起诉讼
   • 操作方式：如果对劳动仲裁裁决不服，安全员可以在收到仲裁裁决书之日起15日内向人民法院提起诉讼。在诉讼过程中，需要提交起诉状、证据材料等，由法院进行审理并作出判决。
   • 优势：诉讼是最具有权威性的解决争议的方式，法院的判决具有最终的法律效力，能够为安全员提供最全面的法律保护。

如果你在项目安全事故扣工资方面还有其他疑问，或者遇到了具体的法律问题，都可以直接向我咨询。