核心结论：兄弟两人身份互换后产生的案底问题，需根据具体情况判断其合法性及后续处理方式，主要分为以下两种情况：
若身份互换行为本身违法（如冒用身份、伪造证件等）
根据《刑法》第280条之一规定，冒用他人身份顶替他人接受刑事处罚的，可能构成“冒名顶替罪”，处三年以下有期徒刑、拘役或者管制，并处罚金。此时：
- 案底归属：实际犯罪人的案底会记录在被冒用身份者名下，导致被冒用者无辜承担法律后果；
- 纠正程序：需通过刑事申诉或再审程序，向法院或检察院提交证据（如DNA鉴定、指纹比对、证人证言等），证明身份被冒用的事实，申请撤销原判决并修正案底记录；
- 法律责任：冒用者除承担原犯罪刑罚外，还需因冒名顶替行为单独受罚；若公职人员参与伪造身份，可能涉及滥用职权罪或包庇罪。
若身份互换行为未被法律禁止（如双胞胎自愿互换身份生活，但未用于违法目的）
- 案底归属：若一方以另一方身份实施犯罪，案底仍会记录在被使用身份名下，但实际犯罪人可能因身份混淆逃避制裁；
- 纠正难点：需证明犯罪行为与身份记录不一致（如犯罪时行为特征、监控录像、通讯记录等），但若证据不足，被使用身份者可能长期背负冤案；
- 建议措施：立即向公安机关报案，说明身份互换情况，并配合调查提供线索；同时可委托律师向法院申请启动再审程序，通过司法鉴定等技术手段还原真相。
补充说明：
- 身份互换行为本身可能涉及多重违法（如伪造身份证件、侵犯公民个人信息等），即使未直接用于犯罪，也可能面临行政处罚或刑事追责；
- 若案底已影响被冒用者的就业、升学等权益，可依据《民法典》第1029条主张名誉权侵权，要求冒用者赔偿损失并公开道歉；
- 司法实践中，身份混淆案件的纠正需依赖充分证据，建议尽早固定关键证据（如早期身份证明、亲友证言、生活轨迹记录等）。
行动建议：
- 立即停止身份互换行为，恢复真实身份；
- 收集能证明身份被冒用的证据（如出生证明、户籍档案、生物样本等）；
- 委托律师协助向公安机关报案，并同步向法院/检察院提交再审申请；
- 若涉及公职人员渎职，可向纪检监察机关举报。
如有进一步细节需要分析，可直接向我说明具体情况，我会结合证据类型和案件阶段为您制定具体方案。