结论：员工干了4个月没干满半年，公司扣除“长期工资”这一做法是否合法，需根据具体情况来判断，一般情况下，若“长期工资”属于不合理的工资构成部分或公司无合法依据扣除，则该做法不合法。以下是对此问题的详细分析：

一、关于“长期工资”的合法性

1. 工资构成：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，且不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。工资构成通常包括基本工资、奖金、津贴、补贴等合法部分。
   • 如果“长期工资”并非法律规定的工资构成部分，而是公司自行设定的、与员工工作年限或表现挂钩的额外奖励或补贴，那么其合法性就取决于公司规章制度或劳动合同中的具体约定。

2. 公司规章制度与劳动合同：

   • 公司规章制度或劳动合同中应明确约定工资的构成、支付方式、扣除条件等。如果“长期工资”的扣除条件在规章制度或劳动合同中有明确规定，且该规定不违反法律法规的强制性规定，那么公司扣除“长期工资”可能是合法的。
   • 然而，如果规章制度或劳动合同中未明确约定“长期工资”的扣除条件，或者约定不明确、不合理，那么公司扣除“长期工资”就可能缺乏合法依据。

二、关于扣除“长期工资”的合法性判断

1. 合法扣除的情形：

   • 如果员工存在违反公司规章制度、劳动合同约定或法律法规的行为，且该行为导致公司遭受损失，公司有权根据规章制度或劳动合同的约定扣除员工的工资作为赔偿。但扣除的工资数额应合理，且不得超过员工当月工资的20%（若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付）。
   • 如果“长期工资”的扣除与员工的上述行为直接相关，且扣除条件在规章制度或劳动合同中有明确约定，那么公司扣除“长期工资”可能是合法的。

2. 非法扣除的情形：

   • 如果员工未存在上述违反行为，或者“长期工资”的扣除与员工的违反行为无直接关联，或者扣除条件在规章制度或劳动合同中未明确约定或约定不合理，那么公司扣除“长期工资”就可能是非法的。
   • 此外，如果公司以“长期工资”为名，实际上是在变相克扣员工的工资，或者将“长期工资”作为对员工的一种惩罚措施，那么这种做法也是非法的。

三、建议与措施

1. 与公司沟通：

   • 如果员工认为公司扣除“长期工资”不合法，首先可以尝试与公司进行沟通，了解扣除的具体原因和依据，并要求公司出示相关的规章制度或劳动合同条款。

2. 申请劳动仲裁或提起诉讼：

   • 如果沟通无果，员工可以向当地的劳动仲裁机构申请劳动仲裁，要求公司支付被扣除的“长期工资”及可能的赔偿金。
   • 如果对劳动仲裁结果不满，员工还可以向人民法院提起诉讼，通过法律途径维护自己的合法权益。

3. 保留证据：

   • 在整个过程中，员工应保留好与公司的沟通记录、工资条、劳动合同等相关证据，以便在需要时提供证明。

最后，如果员工遇到类似问题，且不确定如何处理，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供专业的法律建议。