事业单位能适用事实劳动关系，但需根据具体情况判断其与劳动者之间建立的是劳动关系还是人事关系。以下是对此问题的详细分析：
一、事业单位与事实劳动关系
事实劳动关系的定义：
- 事实劳动关系是指用人单位与劳动者之间未签订书面劳动合同，但双方实际履行了劳动权利和义务而形成的劳动关系。
事业单位中的事实劳动关系：
- 在事业单位中，如果未与劳动者签订书面劳动合同，但劳动者实际为事业单位提供了劳动，并接受了事业单位的管理和指挥，同时从事业单位领取了劳动报酬，那么双方之间就形成了事实劳动关系。
二、事业单位与劳动关系的适用法律
劳动关系的确立与适用法律：
- 当事业单位与劳动者建立劳动关系时，无论是否签订书面劳动合同，均应适用《中华人民共和国劳动法》及《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定。
- 这意味着，在事实劳动关系中，劳动者同样享有劳动法规定的各项权利，如劳动报酬、工作时间、休息休假、劳动安全卫生等。
人事关系与适用法律：
- 对于纳入事业单位编制管理的工作人员，他们与事业单位之间形成的是人事关系，而非劳动关系。这部分人员的工作关系主要由《事业单位人事管理条例》等特别的人事管理制度进行规范。
- 但需要注意的是，即使对于人事关系，在处理某些争议时，如辞职、辞退及履行聘用合同所发生的争议，也可能参照《中华人民共和国劳动法》的规定来处理。
三、事业单位适用事实劳动关系的具体情形
非编制内人员的聘用：
- 事业单位在招聘临时工、合同工等非编制内人员时，如果未签订书面劳动合同，但双方实际履行了劳动权利和义务，就形成了事实劳动关系。
- 在这种情况下，事业单位应依法保障劳动者的合法权益，如支付劳动报酬、提供劳动条件等。
聘用制工作人员的特殊情况：
- 对于实行聘用制的工作人员，如果事业单位在与其订立、履行、变更、解除或者终止劳动合同时，未签订书面合同，但双方实际存在劳动关系，也构成事实劳动关系。
- 在此情形下，事业单位应遵循《劳动合同法》的相关规定，保障劳动者的合法权益。
四、法律建议
签订书面劳动合同：
- 为了避免事实劳动关系带来的法律风险，事业单位应尽可能与劳动者签订书面劳动合同，明确双方的权利和义务。
依法保障劳动者权益：
- 无论是否签订书面劳动合同，事业单位都应依法保障劳动者的合法权益，如支付劳动报酬、提供劳动条件、保障劳动安全等。
及时处理劳动争议：
- 如果发生劳动争议，事业单位应积极与劳动者协商解决，或者依法通过劳动仲裁、诉讼等途径解决争议。
总结：事业单位能适用事实劳动关系，但需根据具体情况判断其与劳动者之间建立的是劳动关系还是人事关系。在事实劳动关系中，事业单位应依法保障劳动者的合法权益，避免法律风险。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。