结论：在起诉时，若企业注册地址与实际经营地址不一致，原则上应选择企业注册地址作为诉讼管辖地，但需注意实际经营地址可能对诉讼产生的影响，并做好应对准备。以下是对此问题的详细分析：
一、诉讼管辖地的确定原则
法定管辖原则：
- 根据《民事诉讼法》及相关司法解释，公司诉讼通常由被告住所地（即注册地址）的法院管辖。这是诉讼管辖的基本原则，旨在确保诉讼的便利性和公正性。
实际经营地址的影响：
- 尽管注册地址是法定的管辖地，但实际经营地址也可能对诉讼产生影响。例如，如果实际经营地址与注册地址相距甚远，可能导致法律文书送达困难，影响诉讼进程。
- 在某些特殊情况下，如合同中明确约定了诉讼管辖地，或实际经营地与合同履行地、侵权行为地等有密切联系，法院也可能根据具体情况确定管辖地。
二、选择注册地址作为诉讼管辖地的理由
法律明确性：
- 选择注册地址作为诉讼管辖地，符合法律明确规定，减少了因管辖地争议而导致的诉讼延误。
便于法院审理：
- 注册地址是公司登记的重要信息，法院可以轻易获取并确认。这有助于法院快速了解案件背景，提高审理效率。
降低诉讼风险：
- 如果选择实际经营地址作为诉讼管辖地，但未能提供充分证据证明该地址与案件有密切联系，可能导致法院不予认可，从而增加诉讼风险。
三、实际经营地址不一致可能带来的问题及应对
法律文书送达问题：
- 如果实际经营地址与注册地址不一致，且未及时告知法院或相关方，可能导致法律文书无法及时送达。这会影响公司在诉讼中的权利行使，如错过开庭时间、面临缺席判决等不利后果。
- 应对：在起诉时，应主动向法院提供公司的实际经营地址，并确保该地址能够及时接收法律文书。同时，可以与法院沟通，确认送达方式，如采用电子送达等便捷方式。
企业信誉与经营影响：
- 注册地址与实际地址不一致可能会让合作伙伴对公司的诚信和经营稳定性产生质疑，损害公司的商业信誉。
- 应对：公司应尽快办理地址变更登记手续，确保实际地址与注册地址一致。同时，在所有商业活动中遵循诚实信用原则，不误导消费者或合作伙伴。
四、建议与措施
及时办理地址变更登记：
- 如果公司实际经营地址已经变更，但未及时办理工商登记变更手续，应尽快准备相关材料（如公司法定代表人签署的《公司变更登记申请书》、加盖公司公章的公司章程修正案、新地址的使用证明等），并提交至当地工商行政管理部门进行变更登记。
在诉讼中主动说明情况：
- 在起诉时，如果实际经营地址与注册地址不一致，应主动向法院说明情况，并提供相关证据（如租赁合同、房产证复印件等）证明实际经营地址的真实性。这有助于法院正确确定诉讼管辖地，并保障公司的诉讼权利。
咨询与协助：
- 如果在诉讼过程中遇到任何问题或困惑，可以直接向我咨询。作为专业律师，我将根据具体情况为你提供详细的法律建议和协助。
综上所述，在起诉时，若企业注册地址与实际经营地址不一致，原则上应选择企业注册地址作为诉讼管辖地。但同时，也需注意实际经营地址可能对诉讼产生的影响，并采取相应的应对措施。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。