运送假烟的车辆是否会被没收，需根据具体情况来判断。以下是对此问题的详细分析：
一、车辆所有人或驾驶员不知情的情况
处理方式：
- 若车辆所有人或驾驶员能证明对运输货物为假烟确实不知情，且无主观故意，车辆通常不会被认定为用于违法犯罪的工具。
- 执法部门在调查清楚后，应及时返还车辆。但在此期间，车辆可能会被依法查封或扣留作为证物。
法律依据：
- 因缺乏犯罪故意，即主观上不知情，不符合犯罪的构成要件，故不承担刑事责任。车辆作为合法财产，应受到保护。
二、车辆所有人或驾驶员知情的情况
作为运输工具被没收：
- 根据《中华人民共和国烟草专卖法》及其实施条例，若车辆所有人或驾驶员明知所运输的是假烟仍参与运输，车辆将被认定为实施违法行为的工具。
- 在此类情况下，车辆可能会被依法没收。具体没收条件包括但不限于：非法运输的烟草专卖品价值超过一定金额、运输卷烟数量超过一定件数、被烟草专卖行政主管部门处罚两次以上等。
可能涉及的刑事犯罪及量刑：
- 销售伪劣产品罪：根据《中华人民共和国刑法》第一百四十条，明知是假烟仍运输，且销售金额达到五万元以上，构成此罪。将面临有期徒刑、拘役及罚金等刑罚，具体量刑根据销售金额大小而定。
- 非法经营罪：根据《中华人民共和国刑法》第二百二十五条，违反国家规定进行非法经营活动，如运输假烟，情节严重的，也将受到刑事处罚。包括有期徒刑、拘役及罚金等。
涉案金额与量刑的关系：
- 销售金额直接影响刑罚轻重。金额越高，刑罚越重。
- 可能并处或单处罚金，甚至没收财产。具体数额与销售金额或违法所得挂钩。
三、车辆被暂扣后的处理流程
积极配合调查：
- 车主或驾驶员应配合执法部门的调查，提供相关证件和信息，以便执法部门尽快查明事实真相。
申请复议或诉讼：
- 若认为车辆被错误扣押或没收，车主或驾驶员有权申请行政复议或提起行政诉讼，以维护自己的合法权益。
四、建议与提醒
增强法律意识：
- 车辆所有人和驾驶员应增强法律意识，了解运输假烟的违法性和可能面临的法律后果。
谨慎检查货物：
- 在承接运输任务前，应仔细核查货物性质，确保合法性。避免卷入违法行为，导致车辆被没收等严重后果。
及时报警与举报：
- 若发现所运货物为假烟或其他违法物品，应立即向公安机关报警或举报。这不仅可以避免自己陷入法律风险，还有助于维护社会的法制秩序和公共利益。
总结来说，运送假烟的车辆是否会被没收，取决于车辆所有人或驾驶员是否知情以及涉案金额大小等因素。若不知情且无违法故意，车辆通常不会被没收；若知情并参与运输假烟，则可能面临车辆被没收、罚款乃至刑事追责等严重后果。因此，建议车辆所有人和驾驶员增强法律意识，谨慎行事，以免触碰法律红线。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。