爷爷和孙子在爸爸不在了的情况下，通常不可以直接做亲子鉴定来确定血缘关系，因为亲子鉴定一般是用于确定父母与子女之间的生物学关系。不过，我们可以从以下几个角度来详细分析这个问题：

1. 亲子鉴定的基本原理：

   • 亲子鉴定是通过比较DNA序列的相似性来确定个体之间的生物学关系。它通常用于确认父母与子女之间的亲缘关系，因为父母与子女之间的DNA序列有较高的相似性。
   • 爷爷和孙子之间的DNA相似性虽然也存在，但不如父母与子女之间那么直接和显著，且亲子鉴定技术主要是设计用于父母与子女关系的确认。

2. 法律上的亲子关系认定：

   • 在法律上，亲子关系通常是通过出生证明、户口本等官方文件来认定的。这些文件记录了父母与子女之间的法律关系，是法律上确认亲子关系的主要依据。
   • 如果爸爸不在了，爷爷和孙子之间的法律关系（如祖父与孙子的关系）并不会因此改变，也不需要通过亲子鉴定来确认。

3. 特殊情况下的考虑：

   • 在某些特殊情况下，如遗产继承、抚养权争议等，可能需要确认爷爷和孙子之间的生物学关系。然而，这种情况下，通常会有其他法律程序或证据来辅助确认，而不仅仅依赖亲子鉴定。
   • 如果确实需要进行生物学关系的确认，可以考虑通过其他家族成员的DNA样本进行间接推断，但这需要专业的遗传学知识和法律程序的支持。

4. 实际操作中的建议：

   • 如果爷爷和孙子之间需要确认某种关系（非法律上的亲子关系），建议咨询专业的遗传学机构或律师，了解可行的方案和法律程序。
   • 在任何情况下，都应尊重法律程序和官方文件，避免通过非法或不正当手段来确认关系。

总结来说，爷爷和孙子在爸爸不在了的情况下，通常不需要也不适合直接做亲子鉴定来确定血缘关系。如果确实需要确认某种关系，建议咨询专业机构或律师，了解合法的、可行的方案。如果你有任何关于婚姻家庭、遗产继承等方面的法律问题，都可以直接向我咨询。