针对您提出的“农村多占有的基本农田怎么处理”的问题，这是一个涉及土地管理、法律法规以及农业保护的重要议题。以下是我为您提供的详细解答：
一、法律定性
首先，需要明确的是，根据《中华人民共和国土地管理法》以及《基本农田保护条例》的相关规定，基本农田是受到严格保护的，禁止任何单位和个人擅自改变其用途或进行非农业建设。这包括但不限于在基本农田上建房、挖塘养鱼、发展林果业等行为。因此，农村多占有基本农田进行非农业用途的行为是违法的。
二、处理程序
对于农村多占有基本农田的行为，相关部门将依法进行严肃处理。处理程序通常包括以下几个步骤：
立案调查：
- 自然资源主管部门在发现或接到举报后，将启动执法程序。
- 通过现场勘查、询问当事人等方式收集证据，确认违法事实及责任主体。
责令整改：
- 对正在实施的违法行为，立即下达《责令停止违法行为通知书》。
- 对已建成的建筑物或设施，要求当事人在限期内自行拆除并恢复土地原状。
强制执行：
- 若当事人拒不履行整改义务，行政机关可依法采取查封施工现场、代履行（由政府组织拆除）等措施。
- 相关费用由违法者承担。
行政处罚：
- 根据情节轻重，对违法者处以罚款，罚款标准通常为每平方米一定金额（如100元至1000元不等）。
- 对直接负责的主管人员和其他责任人依法给予处分。
刑事责任追究：
- 若违法行为涉及非法转让、倒卖土地使用权且数额较大，或造成耕地大量毁坏等严重后果，可能触犯《刑法》相关规定。
- 违法者将面临有期徒刑或拘役并处罚金等刑事处罚。
三、补救措施与责任追究
除了上述处理程序外，违法者还需承担补救措施和责任追究：
补划基本农田：
- 违法者需在规定时间内补划数量和质量相当的基本农田，以确保基本农田总量不减少、质量不降低。
缴纳耕地开垦费或复垦保证金：
- 若无法自行补划，违法者需按照规定缴纳耕地开垦费，由当地政府负责组织开垦新的耕地。
- 或者缴纳复垦保证金，用于后续的土地复垦工作。
四、合法使用基本农田的建议
为了避免违法行为的发生，我建议您：
严格遵守法律法规：
- 在使用土地时，务必遵守相关法律法规的规定，不得擅自改变基本农田的用途。
了解政策动态：
- 及时关注当地政府和相关部门发布的政策动态，了解土地使用的最新要求和规定。
合法申请用地：
- 如需使用土地进行非农业建设，应依法向相关部门提出申请，并按照规定的程序进行审批。
注重生态环境保护：
- 在使用土地时，要注重生态环境保护，减少对周边环境的破坏和影响。
综上所述，农村多占有基本农田的行为是违法的，将受到法律的严肃处理。为了避免违法行为的发生，建议您严格遵守相关法律法规，合法使用土地。如有任何疑问或需要进一步的帮助，请随时咨询当地政府和相关部门。