招标代理单位确实有责任对投标人单位的合法性进行审查，但这种审查是形式上的初步审查，而非实质性的全面审查。以下从不同角度为你详细分析：

法律背景与依据

在招标投标活动中，招标代理单位作为招标人的代理人，承担着协助招标人完成招标工作的职责。根据《中华人民共和国招标投标法》及相关规定，招标代理单位在招标过程中需要履行一系列义务，其中包括对投标人资格进行审查。这种审查主要是为了确保投标人具备参与招标活动的合法资格，维护招标投标活动的公平、公正和公开。

审查内容与范围

招标代理单位对投标人单位的合法性审查，通常包括以下几个方面：

1. 投标人资质证书：检查投标人是否具备从事相关业务的资质证书，如营业执照、税务登记证、组织机构代码证等基本证件，以及特定行业所需的专项资质证书。
2. 投标人业绩与信誉：虽然这不直接涉及合法性，但审查投标人的过往业绩和信誉情况，可以间接评估其履行合同的能力和诚信度，这也是合法性审查的一部分延伸。不过，更深入的业绩和信誉审查往往需要招标人或评标委员会进行。
3. 投标人是否存在违法违规行为：通过查询相关政府部门或行业组织的记录，了解投标人是否存在违法违规行为，如被列入失信被执行人名单、受到行政处罚等。

审查的限度与责任

1. 形式审查为主：招标代理单位的审查主要是形式上的初步审查，即检查投标人提交的文件是否齐全、是否符合招标文件的要求等。对于投标人文件的真实性、准确性和完整性，招标代理单位通常不承担实质性的审查责任。
2. 不免除招标人责任：即使招标代理单位进行了初步审查，招标人仍然需要对投标人的资格进行最终确认。如果因投标人资格问题导致招标失败或产生其他法律后果，招标人可能需要承担相应的责任。
3. 审查的谨慎义务：尽管招标代理单位的审查是形式上的，但其仍然需要尽到谨慎义务，确保审查过程的公正、公平和公开。如果因招标代理单位的疏忽或故意行为导致不合格投标人参与招标活动，招标代理单位可能需要承担相应的法律责任。

实际操作中的建议

1. 明确审查标准：招标代理单位在编制招标文件时，应明确投标人资格审查的标准和流程，确保审查工作的规范性和透明性。
2. 加强沟通与协作：招标代理单位应与招标人保持密切沟通，及时了解招标人对投标人资格的具体要求，确保审查工作符合招标人的期望。
3. 建立审查机制：招标代理单位可以建立一套完善的投标人资格审查机制，包括审查流程、审查标准、审查人员等，确保审查工作的系统性和有效性。

在实际操作中，如果招标代理单位在审查过程中发现投标人存在违法违规行为或不符合招标文件要求的情况，应及时向招标人报告，并按照招标文件的规定处理。如果你在建设工程领域的招标投标活动中遇到任何法律问题，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律意见和帮助。