结论：个人名义的合同原则上应由个人付款，但在特定条件下可以从公司付款，但需满足合规要求并承担相应风险。 以下是具体分析：

1. 合同相对性原则
   根据《民法典》第465条，合同仅对签订双方产生约束力。若合同以个人名义签订，付款义务主体应为个人，公司并非合同当事人，原则上无直接付款义务。若公司代为支付，需基于以下合法情形：

   • 授权委托：个人明确授权公司代为付款（如书面委托书），公司付款可视为代理行为，法律后果由个人承担。
     
   • 债务转移：经合同相对方（如对方公司或个人）同意，将付款义务转移至公司（《民法典》第551条），此时公司成为新债务人。
     
   • 公司自愿承担：公司自愿以自身资金支付，且不违反内部财务制度（如股东会决议、董事会批准等）。

2. 公司付款的合规风险
   即使公司愿意付款，仍需注意以下法律限制：

   • 税务合规：公司资金用于个人合同付款，可能被税务机关认定为“视同分红”或“利益输送”，需按股息红利缴纳20%个人所得税（《企业所得税法》第10条）。
     
   • 财务制度：若公司未履行内部审批流程（如无合法凭证、未计入账目），可能涉嫌违反《公司法》第171条关于财务管理的规定，甚至被认定为“抽逃出资”或“挪用资金”。
     
   • 合同效力：若合同内容涉及公司利益（如个人代公司签约），需确保公司事后追认，否则可能因“无权代理”导致合同对公司无效（《民法典》第171条）。

3. 实务建议

   • 明确资金性质：若公司付款，需通过书面协议约定资金用途（如借款、赠与或代付），避免税务风险。
     
   • 完善内部流程：公司应留存付款审批记录、个人授权文件等证据，证明付款行为合法合规。
     
   • 避免利益冲突：若个人与公司存在关联关系（如股东、高管），需确保付款行为不损害公司或其他股东利益，否则可能引发民事赔偿或行政处罚。

总结：个人合同由公司付款需满足法律要件（如授权、债务转移）并规避税务、财务风险。建议根据具体场景设计交易结构，必要时由律师起草协议或审核流程，确保合法合规。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作方案。