结论：协会秘书长是否可以是其他公司法人，需结合协会章程、相关法律法规以及具体情境综合判断，一般情况下若协会章程无禁止性规定且不违反法律法规，协会秘书长可以由其他公司法人担任，但需注意利益冲突与合规性问题。以下从不同角度详细分析：

一、协会章程的约定

协会作为社团法人，其内部治理结构、成员资格及职务设置等通常由协会章程规定。因此，首先需查阅协会章程，确认其中是否对秘书长的任职资格有明确限制。若章程中明确规定秘书长不得由其他公司法人担任，或设定了其他限制性条件（如需为协会会员、需具备特定专业背景等），则应遵循章程规定。

二、法律法规的考量

1. 《社会团体登记管理条例》等相关法规：

   • 这些法规主要规范社会团体的登记、管理、活动等方面，对于秘书长的任职资格一般无直接限制。但需注意，若协会涉及特定行业或领域，可能还需遵守相关行业或领域的特别法规。

2. 《公司法》及相关规定：

   • 虽然《公司法》主要规范公司的设立、组织、运营等，但若协会秘书长同时担任其他公司法人，需确保其行为不违反《公司法》中关于公司董事、监事、高级管理人员忠实义务和勤勉义务的规定。例如，秘书长在履行协会职务时，不得利用职务之便为所任职的其他公司谋取不正当利益。

3. 利益冲突与合规性：

   • 协会秘书长作为协会的管理者，其职责是维护协会的利益和正常运营。若秘书长同时担任其他公司法人，可能存在利益冲突的风险。因此，需确保秘书长的行为符合法律法规和协会章程的规定，避免损害协会利益。

三、具体情境的分析

1. 若协会章程无禁止性规定：

   • 在协会章程未对秘书长任职资格作出明确限制的情况下，且秘书长的行为不违反法律法规和利益冲突原则，秘书长可以由其他公司法人担任。但需注意，秘书长在履行职务时，应明确区分协会事务与所任职公司的业务，避免混淆。

2. 若存在利益冲突或合规性问题：

   • 若秘书长的行为可能损害协会利益或违反法律法规，即使协会章程未明确禁止，也应避免由其他公司法人担任秘书长。例如，若秘书长所任职的公司与协会存在竞争关系或业务往来，可能引发利益冲突，此时应谨慎考虑秘书长的任职资格。

四、建议与注意事项

1. 完善协会章程：

   • 为避免未来可能出现的争议，建议协会在章程中明确秘书长的任职资格和条件，包括是否可以由其他公司法人担任等。

2. 加强合规管理：

   • 协会应建立健全合规管理制度，确保秘书长的行为符合法律法规和协会章程的规定。对于可能存在的利益冲突，应制定相应的防范措施和应对机制。

3. 咨询专业意见：

   • 在涉及复杂法律问题时，建议协会咨询专业律师或法律顾问的意见，以确保决策的合法性和合规性。

如有更多关于公司法务的疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。