员工在公司上班期间患上癌症，其赔偿问题确实是一个复杂且需要细致分析的情况。以下是我根据相关法律法规和实际情况，为您提供的详细解答：
一、癌症与工作是否相关是关键
若癌症与工作无关：
- 医疗期内的待遇：根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，员工因癌症需要停止工作医疗时，会享有一定期限的医疗期，这个期限根据工作年限可能是3个月到24个月（特殊疾病如癌症通常为24个月）。在医疗期内，公司需要支付病假工资或疾病救济费，这个费用不得低于当地最低工资标准的80%。同时，公司不能随意解除劳动合同。
- 医疗期满后的处理：医疗期满后，如果员工能够继续从事原工作或公司另行安排的工作，那么公司应继续支付正常工资。如果员工不能从事原工作也不能从事公司另行安排的工作，公司可以提前30日以书面形式通知员工本人或额外支付1个月工资后解除劳动合同，并支付相应的经济补偿金。经济补偿金的标准是根据员工在本单位工作的年限来计算的，每满1年支付1个月工资，6个月以上不满1年的按1年计算，不满6个月的支付半个月工资。如果员工月工资高于公司所在地区上年度职工月平均工资三倍，那么经济补偿金的标准会按职工月平均工资三倍的数额支付，但最高不超过十二年。
若癌症被认定为职业病：
- 认定流程：员工需要向职业病诊断机构提出申请，进行职业病诊断。诊断机构会出具职业病诊断证明书。
- 赔偿项目：如果公司依法为员工缴纳了工伤保险，员工可以享受工伤保险待遇，包括医疗费用、康复费用、住院伙食补助费、交通食宿费、辅助器具费、停工留薪期工资等。在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。如果构成伤残，员工还可以享受一次性伤残补助金、伤残津贴等。如果员工因职业病死亡，其近亲属可以领取丧葬补助金、一次性工亡补助金和供养亲属抚恤金。此外，如果公司存在过错导致员工患职业病，公司还需要承担医疗费、护理费、残疾赔偿金、死亡赔偿金等民事赔偿责任。
二、其他可能的赔付途径
- 基本医疗保险：无论癌症是否与工作相关，员工都可以通过基本医疗保险报销部分医疗费用，减轻个人医疗负担。报销比例和范围依据当地医疗保险政策而定。
- 公司福利与商业保险：部分公司会为员工提供额外的商业保险，如重疾险、医疗险或团险等。员工需要查看保险合同条款，了解是否符合赔付条件。如果符合合同要求，员工可以向保险公司申请赔付。
三、建议与注意事项
- 员工在患癌后，应首先确认癌症是否与工作相关。如果为职业病或与工作环境有关，应积极寻求工伤认定和民事赔偿途径。
- 同时，员工应了解自己是否享有基本医疗保险和商业保险的保障，及时申请报销和赔付。
- 在处理赔付问题时，员工应保留好相关证据和文件，如医疗记录、诊断证明、保险合同等，以便在需要时提供证明。
- 如果遇到赔付纠纷或公司不配合的情况，员工可以咨询专业律师或法律援助机构，维护自己的合法权益。
综上所述，员工在公司上班期间患上癌症的赔偿问题需要根据具体情况进行综合分析。员工应了解自己的权益和保障措施，积极寻求合法的赔付途径。