虚进虚出增值税发票是严重的违法行为，不仅会对税收征管秩序造成破坏，还可能导致国家税款的流失。以下是对虚进虚出增值税发票处理的详细解答：

一、行政处罚

对于虚开发票的行为，税务机关将依据《中华人民共和国发票管理办法》给予以下行政处罚：

1. 没收违法所得：对于通过虚开发票所取得的非法所得，税务机关将依法予以没收。
2. 罚款：
   • 虚开金额在1万元以下的，税务机关可以并处5万元以下的罚款。
   • 虚开金额超过1万元的，将并处5万元以上50万元以下的罚款。

若构成犯罪，则还需依法追究刑事责任，此时的罚款数额可能会更高，甚至不受上述限额的限制。

二、刑事责任

虚开增值税专用发票或用于骗取出口退税、抵扣税款的其他发票，属于刑法中的犯罪行为，将依据相关法律规定受到严厉的刑事处罚：

1. 基本量刑标准：

   • 虚开的税款数额较大（一般指税额在5万元以上）的，将处三年以下有期徒刑或者拘役，并处二万元以上二十万元以下罚金。
   • 虚开的税款数额巨大或有其他严重情节（如虚开税额在50万元以上或造成国家税款损失30万元以上等）的，将处三年以上十年以下有期徒刑，并处五万元以上五十万元以下罚金。
   • 虚开的税款数额特别巨大或有其他特别严重情节（如虚开税额在250万元以上或造成国家税款损失150万元以上等）的，将处十年以上有期徒刑或者无期徒刑，并处五万元以上五十万元以下罚金或者没收财产。

2. 单位犯罪的处罚：

   • 对于单位犯此罪的，将对单位判处罚金。
   • 同时，对其直接负责的主管人员和其他直接责任人员，将依照上述自然人犯罪的规定进行处罚。

3. 从轻或减轻处罚的情节：

   • 在提起公诉前，若能够积极退赃退赔、补缴税款、挽回税收损失，并有效进行合规整改的，可以从宽处罚。
   • 若犯罪情节轻微不需要判处刑罚的，可以不起诉或者免予刑事处罚。
   • 若情节显著轻微且危害不大的，则不作为犯罪处理。

4. 数罪并罚的情况：

   • 若虚开发票的行为同时构成其他犯罪（如逃税罪、诈骗罪等），则将依照处罚较重的规定进行定罪处罚。

三、税务处理

根据《国家税务总局关于纳税人虚开增值税专用发票征补税款问题的公告》，对于纳税人虚开的增值税专用发票，若未就其虚开金额申报并缴纳增值税的，应按照其虚开金额补缴增值税。已就其虚开金额申报并缴纳增值税的，则不再按照其虚开金额补缴增值税。同时，纳税人取得的虚开增值税专用发票不得作为增值税合法有效的扣税凭证抵扣其进项税额。

综上所述，虚进虚出增值税发票是严重的违法行为，将受到严厉的行政处罚和刑事处罚。因此，建议所有纳税人和相关从业者严格遵守税收法规，确保发票的真实性和合法性。