合同中约定在诉讼有效期内自动扣款，并不一律构成诉讼时效中断。诉讼时效的中断是指在诉讼时效期间内，因发生法定事由，致使已经经过的时效期间归于无效，待时效中断的事由消除后，诉讼时效期间重新计算。针对您提出的问题，我将从以下几个方面进行详细分析：
一、自动扣款与诉讼时效中断的关系
自动扣款行为的性质：
- 自动扣款通常是合同双方约定的，在特定条件下（如到期未还款）由一方自动从另一方账户中扣除款项的行为。这种行为本身并不直接等同于债权人向债务人主张权利。
诉讼时效中断的法定事由：
- 根据《中华人民共和国民法典》及相关司法解释，诉讼时效中断的法定事由主要包括：权利人向义务人提出履行请求、义务人同意履行义务、权利人提起诉讼或者申请仲裁等。
- 自动扣款行为并不直接属于上述法定事由中的任何一种。它更多是一种合同履行方式，而非权利人主动主张权利的行为。
二、可能构成诉讼时效中断的情形
扣款行为伴随权利主张：
- 如果在自动扣款的同时，债权人通过书面通知、短信、邮件等方式明确向债务人主张了权利，并说明了扣款的原因和依据，那么这种行为可能构成诉讼时效的中断。
债务人认可扣款行为：
- 如果债务人以书面形式或其他明确方式认可了自动扣款行为，并表示愿意继续履行合同或承担相应责任，这也可能构成诉讼时效的中断。
三、不构成诉讼时效中断的情形
单纯自动扣款，无权利主张：
- 如果自动扣款行为仅仅是按照合同约定进行，没有伴随债权人的任何权利主张行为，那么这种行为通常不会构成诉讼时效的中断。
债务人未认可扣款行为：
- 如果债务人对自动扣款行为提出异议，或者未以任何方式表示认可，那么这种行为也不太可能构成诉讼时效的中断。
四、法律建议
明确约定权利主张方式：
- 在合同中明确约定，在自动扣款的同时或之前，债权人应通过何种方式向债务人主张权利，以确保诉讼时效的中断。
保留相关证据：
- 无论是自动扣款还是其他形式的权利主张，都应保留好相关证据，如书面通知、短信、邮件、扣款记录等，以备不时之需。
及时咨询专业律师：
- 如果您对诉讼时效的中断有疑问或担忧，建议及时咨询专业律师，以便根据具体情况制定合适的法律策略。
综上所述，合同中约定在诉讼有效期内自动扣款并不一律构成诉讼时效中断。是否构成中断取决于扣款行为是否伴随债权人的权利主张以及债务人的认可情况。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。