公司股东扣留客户资金的行为，在大多数情况下是违法的，具体分析如下：
从公司法角度分析：
- 公司作为独立的法人实体，拥有独立的财产权。股东作为公司的出资人，其出资后，该部分财产即成为公司财产，股东不再直接享有所有权。因此，股东无权直接扣留或处置公司客户资金，这些资金属于公司资产，应由公司按照法定程序和公司章程进行管理和使用。
- 如果股东擅自扣留客户资金，可能构成对公司财产权的侵犯，公司有权要求股东返还资金，并可能追究其法律责任。
从合同法角度分析：
- 公司与客户之间通常存在合同关系，客户资金往往作为合同履行的对价或保证金等存在。股东扣留客户资金，可能违反公司与客户之间的合同约定，构成违约行为。
- 客户有权依据合同约定要求公司履行义务，包括返还被扣留的资金。如果公司因股东行为无法履行合同，客户还可能要求公司承担违约责任，甚至解除合同。
从刑法角度分析（在特定情况下）：
- 如果股东扣留客户资金的行为情节严重，如数额巨大、持续时间较长、造成严重后果等，可能构成刑法上的犯罪行为，如职务侵占罪、挪用资金罪等。
- 在这种情况下，股东不仅可能面临民事赔偿责任，还可能受到刑事处罚，包括有期徒刑、罚金等。
法律建议：
- 对于公司而言，应建立健全的财务管理制度，明确股东、管理层和员工的职责和权限，防止股东擅自扣留或处置公司资产。
- 如果发现股东有扣留客户资金的行为，公司应及时采取措施，如要求股东返还资金、解除其职务、提起民事诉讼等，以维护公司利益和客户权益。
- 在必要时，公司还可以向公安机关报案，追究股东的刑事责任。
可能后果：
- 股东可能面临公司的民事索赔，要求返还资金并赔偿损失。
- 股东可能因违反合同约定而承担违约责任，包括支付违约金、赔偿损失等。
- 在情节严重的情况下，股东可能面临刑事处罚，影响其个人声誉和未来职业发展。
总结与启示：
公司股东扣留客户资金的行为是违法的，不仅可能损害公司利益和客户权益，还可能使股东面临严重的法律后果。因此，建议公司加强内部管理，确保股东行为合法合规；同时，股东也应自觉遵守法律法规和公司章程，维护公司利益和股东间的和谐关系。如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。