结论：游戏有版号但名字不一样，其合法性不能一概而论，需结合具体情况分析。以下从不同角度为你详细阐述：

从版号与游戏名称的关联性角度

版号是国家新闻出版广播电影电视总局同意相关游戏出版上线运营的批准文件编号，它主要关注的是游戏的内容、运营等方面是否符合相关规定和要求，重点在于对游戏整体合规性的审查，而非单纯聚焦于游戏名称。

如果游戏在申请版号时所使用的名称与实际运营时使用的名称不同，但游戏的核心内容、玩法、运营模式等与申请版号时提交的资料一致，且运营名称没有侵犯他人的商标权、著作权等合法权益，那么这种名称的差异可能不会直接影响游戏的合法性。不过，这种行为可能存在一定风险，因为版号审批是基于特定名称下的游戏内容，名称变更后，从严格意义上讲，相当于运营的游戏与获得版号的游戏在标识上出现了不同，可能会面临监管方面的质疑。

从商标权角度

如果游戏运营时使用的名称已经被他人注册为商标，且该商标处于有效保护期内，那么使用该名称进行游戏运营就可能构成商标侵权。即使游戏本身有版号，也不能成为侵犯他人商标权的合法理由。

例如，A公司开发了一款游戏并获得了版号，当时游戏名称为“游戏甲”。后来A公司在运营过程中将游戏名称改为“游戏乙”，而“游戏乙”已经被B公司注册为商标。在这种情况下，A公司使用“游戏乙”作为游戏名称进行运营，就可能面临B公司的商标侵权指控，需要承担相应的法律责任，如停止侵权行为、赔偿损失等。

从著作权角度

如果游戏运营时使用的名称具有独创性，构成著作权法意义上的作品，那么该名称就受到著作权的保护。如果其他人在未经授权的情况下使用相同或相似的名称进行游戏运营，就可能侵犯名称的著作权。

不过，与商标权不同的是，著作权的保护范围相对较窄，主要侧重于对作品表达形式的保护。如果两个游戏名称在文字表述上存在一定差异，但整体上不会导致公众产生混淆和误认，那么可能不构成著作权侵权。但如果名称的相似度较高，且能够证明后者存在抄袭、剽窃等行为，那么就可能构成侵权。

法律建议

1. 确保名称合法性：在游戏运营前，要对拟使用的名称进行全面的法律检索，包括商标检索、著作权检索等，确保该名称没有侵犯他人的合法权益。如果发现存在潜在的侵权风险，应及时更换名称或与权利人协商解决。
2. 及时办理变更手续：如果游戏在获得版号后需要变更名称，应及时向相关部门办理变更手续，确保游戏的运营与版号信息一致。同时，要保留好变更名称的相关证据，以备不时之需。
3. 加强知识产权保护意识：游戏开发者和运营者要增强知识产权保护意识，尊重他人的知识产权，避免因侵权行为而面临法律风险和经济损失。同时，也要积极维护自己的知识产权，及时对游戏名称、角色形象、剧情等内容进行商标注册和著作权登记，为自己的游戏运营提供有力的法律保障。

如果你在游戏运营过程中遇到与名称相关的法律问题，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律建议和解决方案。