结论前置：公司裁员工资赔偿是按应发工资计算的，这一原则在《中华人民共和国劳动合同法》及其实施条例中有明确规定，旨在确保劳动者在被裁员时能够获得合理的经济补偿。
一、应发工资与实发工资的定义及区别
应发工资：指劳动者在提供正常劳动的情况下，按照劳动合同约定或法律规定应当获得的全部工资性收入。这包括基本工资、奖金、津贴、补贴等所有货币性收入，且未扣除个人所得税、社保等个人应承担的费用。
实发工资：在应发工资的基础上，扣除了个人所得税、社保等个人应承担的费用后，实际发放到劳动者手中的工资数额。
二、裁员赔偿为何按应发工资计算
法律依据：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法实施条例》第二十七条的规定，劳动合同法第四十七条所述的经济补偿月工资，应按照劳动者应得工资进行计算。这包括计时工资或计件工资，以及奖金、津贴和补贴等货币性收入。
保护劳动者权益：
- 采用应发工资作为裁员赔偿的计算基数，能够更全面地反映劳动者的实际收入情况，包括固定薪资以外的奖金、津贴等收入。这有助于确保劳动者在被裁员时获得更为公正、合理的经济补偿，体现了法律对劳动者权益的保护。
三、裁员赔偿的具体计算标准
- 一般补偿标准：
- 经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。
- 六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。
计算公式：经济补偿金 = 工作年限 × 月工资（应发工资）
- 高工资劳动者的特殊补偿标准：
- 若劳动者月工资高于用人单位所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资三倍的，向其支付经济补偿的标准按职工月平均工资三倍的数额支付。
- 向其支付经济补偿的年限最高不超过十二年。
计算公式：经济补偿金 = min(工作年限 × 月工资（应发工资）， 12 × 职工月平均工资三倍)
- 其他特殊情况：
- 若劳动者在劳动合同解除或者终止前12个月的平均工资低于当地最低工资标准的，按照当地最低工资标准计算。
- 对于工作不满12个月的劳动者，工资将按照实际工作的月数来计算平均工资。
四、实际操作中的注意事项
保留证据：
- 劳动者在面临裁员时，应保留好相关证据材料，如工资条、社保缴纳记录等，以便在需要时证明自己的应发工资情况。
核对计算：
- 用人单位在计算裁员赔偿时，应严格按照法律法规的要求，以应发工资为基准进行计算，避免因计算错误而引发劳动争议。
法律救济：
- 如果用人单位未按照法定标准支付裁员赔偿，劳动者有权向劳动仲裁部门申请仲裁或向法院提起诉讼，以维护自己的合法权益。
五、举例说明
假设某员工在公司工作了5年，月应发工资为8000元（包括基本工资6000元、奖金1000元、津贴1000元），实发工资为6500元（扣除税费及保险费用后）。若公司决定裁员，则应支付该员工经济补偿金为：5年 × 8000元/月 = 40000元。
综上所述，公司裁员工资赔偿是按应发工资计算的，这一原则在法律法规中有明确规定，并体现了对劳动者权益的保护。在实际操作中，用人单位和劳动者都应明确这一点，以确保裁员过程的合法性和公正性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。