结论：团险单位与保险公司签订赔付金额小于保险凭证的情况是否合法，需分情况讨论，关键在于合同条款的约定及是否违反法律强制性规定。具体分析如下：

1. 若保险凭证（如保险单、保险条款）中明确约定了赔付金额或赔付标准，且合同未赋予保险公司单方调整赔付金额的权利
   此时保险公司与团险单位签订的赔付金额小于保险凭证的约定，可能构成违约或违法。因为保险合同属于格式合同，保险公司作为提供方，其条款对投保人具有约束力，除非投保人明确同意修改或存在法定变更事由（如保险标的价值减少），否则保险公司无权单方降低赔付金额。若保险公司擅自降低赔付，团险单位可依据《保险法》及合同约定主张保险公司履行赔付义务，甚至要求赔偿损失。

2. 若保险凭证中未明确约定具体赔付金额，仅约定赔付范围或计算方式（如“按实际损失的80%赔付”）
   此时保险公司与团险单位通过补充协议约定具体赔付金额，只要不违反法律强制性规定（如《保险法》中关于赔付比例的最低限制）或显失公平，一般具有法律效力。例如，若保险条款约定“赔付比例由双方协商确定”，则双方通过协商确定的赔付金额即使低于保险凭证中的范围，也可能被认定为合法。

3. 若保险公司与团险单位签订的赔付金额调整协议存在法定无效情形
   例如，保险公司利用优势地位迫使团险单位接受不公平条款（如“赔付金额由保险公司单方决定”），或协议内容违反《保险法》中关于赔付义务的强制性规定（如“保险公司不得通过协议免除法定赔付责任”），则该协议可能被认定为无效，团险单位仍可要求保险公司按保险凭证约定赔付。

建议：

• 团险单位应仔细审查保险凭证及补充协议条款，明确赔付金额的约定方式及调整条件；
  
• 若发现保险公司擅自降低赔付金额，可先与保险公司协商，协商不成可向当地银保监会投诉或通过诉讼主张权利；
  
• 签订补充协议时，建议团险单位要求保险公司明确赔付金额的计算依据及法律依据，避免模糊条款导致争议。
  

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