结论：邻居购买二手独栋别墅未经过其他邻居签字即办好房产证，这一行为本身在法律程序上是合法的，但可能涉及相邻关系中的其他法律问题需进一步审查。

1. 房产证办理的合法性
   根据《中华人民共和国民法典》及《不动产登记暂行条例》，房产证的办理主要依据是买卖双方签订的合法有效的房屋买卖合同、完税证明、身份证明等材料，并需向不动产登记机构申请登记。其他邻居的签字并非房产证办理的法定要件，因此只要买卖程序合法、材料齐全，不动产登记机构依法办理房产证的行为是合法的。

2. 相邻关系中的潜在问题
   虽然房产证办理合法，但若该别墅的买卖或使用涉及以下情形，可能引发相邻权纠纷：

   • 规划变更或违建：若原业主或新业主在别墅范围内进行扩建、改建等行为，可能违反城乡规划法规，侵犯其他邻居的通风、采光、通行等相邻权。此时，受影响邻居可依据《民法典》第288-296条主张权利，要求停止侵害、排除妨碍或赔偿损失。
     
   • 共有部分使用争议：若别墅与周边邻居存在共有部分（如围墙、道路、绿化等），新业主未经协商单方改变使用方式，可能引发共有权纠纷。
     
   • 历史遗留问题：如原业主与邻居存在未解决的纠纷（如边界争议、噪音扰民等），新业主可能需继承相关义务，否则可能面临诉讼。

3. 建议行动方向

   • 核实房产证合法性：其他邻居可向当地不动产登记中心查询该别墅的登记信息，确认是否存在虚假材料或程序违法（如冒充签字、伪造合同等）。若发现违法情形，可申请行政复议或提起行政诉讼撤销房产证。
     
   • 审查相邻权是否受损：若新业主的使用行为已实际影响相邻权，可先通过协商、物业或居委会调解解决；协商无果的，可向法院提起相邻权纠纷之诉，要求停止侵害并赔偿损失。
     
   • 关注规划许可：若怀疑别墅存在违建，可向城管部门举报，要求依法查处。

总结：房产证办理程序合法不等于使用行为合法，邻居无需因未签字而质疑房产证效力，但应关注自身相邻权是否受损。如有具体纠纷，可进一步提供细节，我将为您分析维权路径。