针对您提出的问题，即“车主是爸爸，儿子开了闯红灯扣分是扣谁的驾驶证”，我们可以从以下几个方面进行详细解答：

首先，我们需要明确的是，交通违章的处罚对象主要是基于交通技术监控记录资料来确定。根据《中华人民共和国道路交通安全法》的相关规定，当交通技术监控记录到机动车违法时，存在两种情形：

1. 能够确定违法驾驶人的：在这种情况下，交警部门会依法对驾驶人作出处理，即扣分和罚款都会直接关联到实际驾驶人的驾驶证上。

2. 不能确定违法驾驶人的：如果无法从监控记录中明确辨认出违法驾驶人，那么交警部门有权对违法的机动车所有人或者管理人依法予以处罚。但这一规定并不意味着车主或管理人必须承担所有责任，它更多是一种备选方案，用于在无法确定驾驶人时的一种处理方式。

现在，我们回到您提出的具体情境：车主是爸爸，但实际驾驶人是儿子，且儿子闯了红灯。在这种情况下：

• 如果交通技术监控设备能够清晰地记录到儿子的面部特征或驾驶行为，从而确定儿子是违法驾驶人，那么扣分和罚款将直接关联到儿子的驾驶证上。
• 如果监控设备无法清晰记录到驾驶人的身份，理论上交警部门可能会考虑对车主（即爸爸）进行处罚。但在实际操作中，由于家庭成员之间可能存在车辆共享的情况，且为了更准确地执行法律，交警部门通常会鼓励或要求车主提供实际驾驶人的信息，以便对真正的违法者进行处罚。

此外，值得注意的是，现在通过“交管12123”手机APP等线上平台，家庭成员之间可以相互备案非本人机动车，并处理备案后的交通违法行为。这意味着，如果儿子用自己的驾驶证在APP上备案了爸爸的车辆，那么他就可以处理自己驾驶该车辆时产生的交通违法行为，包括闯红灯的扣分和罚款。

综上所述，对于您提出的问题，如果能够确定儿子是违法驾驶人，那么扣分将扣在儿子的驾驶证上。如果无法确定驾驶人，理论上可能会考虑对车主（爸爸）进行处罚，但在实际操作中，交警部门会倾向于找到真正的违法者进行处理。同时，利用线上平台进行车辆和驾驶证的备案，可以更方便地处理家庭成员之间的交通违法行为。