关于“医院地下车库禁止新能源汽车进入是否违法”的问题，结论前置如下：
- 若医院地下车库的管理规定或合同中有明确禁止新能源汽车进入的条款，且该条款不违反法律法规的强制性规定，则该规定具有合法性。
- 若医院地下车库的管理规定或合同中未明确禁止新能源汽车进入，或禁止条款违反法律法规的强制性规定，则该规定可能不具有合法性。
详细分析如下：
一、合法性分析
管理权与合同约定：
- 医院地下车库的管理方（如医院后勤部门或委托的物业公司）有权根据车库的实际情况和管理需要，制定并执行相应的管理制度和规定。这些规定可能包括禁止新能源汽车进入，以确保车库的正常使用、安全以及维护其他车主的权益。
- 如果车主在与医院或管理方签订的相关合同（如停车服务合同）中，明确约定了地下车库的使用规则，包括禁止新能源汽车进入的内容，且车主签字确认，那么车主应遵守该约定。
法律依据：
- 根据《民法典》等相关法律法规，物业管理方或车库所有权人有权对车库进行管理，并制定相应的管理规定。这些规定在不违反法律法规强制性规定的前提下，对车主具有约束力。
- 需要注意的是，任何管理规定都不得违反法律法规的强制性规定，如不得歧视特定类型的车辆或车主，不得侵犯车主的合法权益等。
二、合理性分析
安全考虑：
- 医院地下车库可能因设计、结构或设施等原因，对新能源汽车的进入存在安全隐患。例如，新能源汽车的电池可能因温度、湿度等环境因素而引发安全问题，或者车库的充电设施可能不完善，无法满足新能源汽车的充电需求。
- 如果医院地下车库确实存在上述安全隐患，且管理方能够提供充分的证据证明禁止新能源汽车进入是出于安全考虑，那么该规定可能具有一定的合理性。
管理便利性：
- 禁止新能源汽车进入可能有助于医院地下车库的管理和维护。例如，可以减少因新能源汽车充电而引发的纠纷或事故，或者避免新能源汽车占用过多停车位导致其他车主停车困难。
- 然而，这种管理便利性不应成为侵犯车主合法权益的理由。如果医院地下车库能够通过合理规划和管理，满足新能源汽车的停车和充电需求，那么禁止新能源汽车进入的规定可能缺乏合理性。
三、特殊情况考虑
- 紧急情况或特殊需求：如遇新能源汽车车主因紧急情况（如病人急需就医）需要进入地下车库，管理方应在确保安全的前提下允许其临时进入。
- 新能源汽车的特殊性：新能源汽车作为环保、节能的交通工具，应得到一定的鼓励和支持。如果医院地下车库能够提供相应的充电设施和服务，那么禁止新能源汽车进入的规定可能不利于新能源汽车的推广和使用。
四、法律建议
- 对于医院地下车库管理方：在制定管理规定时，应充分考虑新能源汽车的特点和需求，确保规定既符合法律法规的要求，又兼顾车主的合法权益。如果确实需要禁止新能源汽车进入，应提供充分的理由和证据，并考虑设置合理的例外情况。
- 对于新能源汽车车主：在进入医院地下车库前，应仔细阅读并遵守相关规定。如果认为规定不合理或侵犯了自己的合法权益，可以与管理方进行沟通协商，或者寻求法律援助。
五、可能的法律后果
- 如果医院地下车库的管理规定违反了法律法规的强制性规定或侵犯了车主的合法权益，车主有权向相关部门投诉或提起诉讼，要求管理方撤销或修改相关规定，并可能获得相应的赔偿。
综上所述，医院地下车库禁止新能源汽车进入是否违法，取决于管理规定的合法性、合理性以及是否存在特殊情况。如果您对此有进一步的疑问或需要具体的法律帮助，请直接向我咨询。