结论：20多年前流转的土地现在确权在本人名下，是否违法不能一概而论，需要结合流转的具体情况、流转后的使用情况以及相关法律法规的规定来综合判断。以下从不同角度进行分析：
一、流转合法且符合确权条件的情况
流转程序合法：如果20多年前的土地流转是依法进行的，比如经过了村集体经济组织或村民委员会的同意，并办理了相关的流转手续，那么这种流转是合法的。
流转后使用合规：流转后，土地的使用者（可能是您本人或之前的流转受让方）按照法律法规的规定和流转合同的约定使用了土地，没有改变土地的农业用途，也没有进行违法建设等活动。
确权条件满足：现在确权时，您作为土地的实际使用者或合法继承人（如果流转后土地又回到了您或您的继承人名下），满足了确权的相关条件，如提供了必要的证明材料、符合当地的确权政策等。
在这种情况下，土地确权在您名下是合法的，不违反相关法律法规。
二、流转存在瑕疵或违法的情况
流转程序不合法：如果20多年前的土地流转没有依法进行，比如没有经过村集体经济组织或村民委员会的同意，或者没有办理相关的流转手续，那么这种流转可能存在瑕疵或违法。
流转后使用违规：流转后，土地的使用者改变了土地的农业用途，或者进行了违法建设等活动，违反了相关法律法规的规定。
确权条件不满足：现在确权时，您无法提供必要的证明材料，或者不符合当地的确权政策等。
在这种情况下，土地确权在您名下可能存在问题，甚至可能违反相关法律法规。 如果确权过程中存在争议或纠纷，可能需要通过法律途径来解决，比如提起行政诉讼或民事诉讼等。
三、特殊情况考虑
历史遗留问题：由于20多年前的时间跨度较长，可能存在一些历史遗留问题，如流转手续的缺失、流转合同的丢失等。在这种情况下，需要结合当地的政策规定和实际情况来综合判断。
政策变化：随着时间的推移，相关法律法规和政策可能发生了变化。在确权时，需要遵循最新的法律法规和政策规定。
法律建议
查阅相关法律法规：建议您查阅《中华人民共和国土地管理法》、《中华人民共和国农村土地承包法》等相关法律法规，了解土地流转和确权的具体规定。
咨询当地部门：由于土地流转和确权涉及当地的政策规定和实际情况，建议您咨询当地的土地管理部门或农业部门，了解具体的政策和操作流程。
寻求法律帮助：如果您在土地流转和确权过程中遇到争议或纠纷，或者对相关法律法规和政策规定有疑问，可以向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律意见和帮助。