结论：民间借贷未约定还款时间，第二年还了一次后，剩余部分是否超过诉讼时效，需根据具体情况判断，但通常情况下，剩余部分的债权并未超过诉讼时效。

分析说明：

1. 诉讼时效的基本规定：

   • 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。对于民间借贷纠纷，通常适用三年的诉讼时效期间。

2. 未约定还款时间的处理：

   • 在民间借贷中，如果双方未约定还款时间，那么债权人可以随时要求债务人还款。此时，诉讼时效的起算点通常是从债权人要求债务人还款，而债务人拒绝还款或未予回应之日起算。

3. 第二年还款的影响：

   • 如果在第二年，债务人还了一部分款项，这可以视为债务人承认了债务的存在，并且愿意履行部分还款义务。这一行为通常会导致诉讼时效的中断，即从中断时起，诉讼时效期间重新计算。
   • 诉讼时效中断后，剩余部分的债权诉讼时效期间会重新开始计算，因此，在第二年还款后，剩余部分的债权诉讼时效并未超过（假设从第二年还款时起算，至今未超过三年）。

4. 超过四年的情况：

   • 如果从第二年还款时起算，至今已经超过四年，但关键在于这四年内是否有其他导致诉讼时效中断或中止的情形。例如，如果债权人在这四年内多次向债务人催款，或者债务人承诺还款等，都可能导致诉讼时效的中断或中止。
   • 如果没有这些情形，且从第二年还款时起算已经超过三年（民法典规定的诉讼时效期间），那么剩余部分的债权可能会面临超过诉讼时效的风险。但根据题目描述，“第二年还了一次”后至今“超过4年”，若这“超过的4年”是从第二年还款时开始连续计算的，且中间无诉讼时效中断、中止情形，理论上剩余债权似乎超过了诉讼时效；然而，实践中，由于诉讼时效的起算、中断、中止等情形较为复杂，且需要具体证据支持，因此不能仅凭时间跨度就断定超过诉讼时效。

法律建议：

• 收集证据：债权人应尽可能收集与债务相关的证据，如借款合同、还款记录、催款通知等，以证明债权的存在和诉讼时效的中断或中止。
• 及时主张权利：如果债权人发现债务人可能逾期未还款，应及时向债务人主张权利，并保留好相关证据，以避免诉讼时效过期。
• 咨询专业律师：对于复杂的民间借贷纠纷，建议债权人咨询专业律师，以便更准确地判断诉讼时效的情况，并采取相应的法律措施。

特殊情况说明：

• 如果债务人在第二年还款时，明确表示了剩余款项的还款计划或时间，那么诉讼时效的起算点可能会从该计划或时间届满之日起算。
• 如果存在其他导致诉讼时效中断或中止的情形，如债务人下落不明、债权人因不可抗力无法行使请求权等，那么诉讼时效的计算也会相应受到影响。