结论前置：

1. 一般情况下有效：只有盖章没有签字的协议，在大多数情况下是有效的，但具体效力还需根据相关法律法规、合同的具体内容以及当事人的真实意图等综合判断。
2. 特殊情况可能无效：若存在盖章主体不具备相应资格、印章伪造或被盗用、合同内容违反法律法规强制性规定等情形，则协议可能无效。

法律分析：

合同成立与生效的法律依据

根据《中华人民共和国民法典》第四百九十条，当事人采用合同书形式订立合同时，签名、盖章或按指印具有同等法律效力，均能使合同成立。这意味着，仅有盖章而没有签字的协议，同样可以视为合同已经成立。进一步地，该法条还规定，即使未完成签名、盖章或按指印的形式要件，但只要一方已履行主要义务且对方接受，合同即告成立。这强调了法律对当事人真实意思表示和实际履行行为的重视。

合同生效的一般原则

根据《中华人民共和国民法典》第五百零二条，依法成立的合同，自成立时即生效，除非法律另有规定或当事人另有约定。因此，对于仅盖章未签字的协议，若其已根据第四百九十条的规定成立，且不存在其他导致合同无效的情形，则协议自成立时即生效。

特殊情况下的协议效力

1. 盖章主体不具备相应资格：

   • 如果盖章的主体不是协议的当事人，或者不具有相应的民事行为能力或协议主体资格（如分公司未经总公司授权），那么协议的效力可能会受到质疑，甚至被认定为无效。

2. 印章伪造或被盗用：

   • 如果印章是伪造的或被他人盗用后加盖在协议上的，该盖章行为不能代表当事人的真实意思表示，协议通常会被认定为无效。在此类情况下，受害方应尽快采取法律措施保护自身权益。

3. 违反法律法规强制性规定：

   • 即使协议有盖章，但如果协议内容违反法律法规的强制性规定，如涉及非法交易、侵犯公共利益等，协议也将被视为无效。

综合考虑因素

在判断只有盖章没有签字的协议是否有效时，应综合考虑多种因素，包括但不限于相关法律法规的具体要求、协议的具体内容（如是否明确规定了生效条件）、当事人的真实意图以及实际履行情况等。

实际操作建议：

• 尽量完善形式要件：为避免未来可能出现的纠纷，建议在签订协议时，尽量按照法律法规和惯例要求，完成所有必要的形式要件，如签名、盖章等，并确保协议内容清晰、明确、无歧义。
• 审查盖章主体资格：在签订协议前，应仔细审查盖章主体的资格，确保其具有相应的民事行为能力和协议主体资格。
• 注意印章的真实性：确保所使用的印章是真实的，且未被伪造或盗用。如有必要，可以要求对方提供印章的备案证明或进行其他形式的验证。
• 及时咨询法律意见：如遇协议效力争议或其他法律问题，应及时向我咨询，以便获得更具体、更准确的法律意见和指导。

法律依据：

• 《中华人民共和国民法典》第四百九十条：当事人采用合同书形式订立合同的，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。在签名、盖章或者按指印之前，当事人一方已经履行主要义务，对方接受时，该合同成立。法律、行政法规规定或者当事人约定合同应当采用书面形式订立，当事人未采用书面形式但是一方已经履行主要义务，对方接受时，该合同成立。
• 《中华人民共和国民法典》第五百零二条：依法成立的合同，自成立时生效，但是法律另有规定或者当事人另有约定的除外。依照法律、行政法规的规定，合同应当办理批准等手续的，依照其规定。未办理批准等手续影响合同生效的，不影响合同中履行报批等义务条款以及相关条款的效力。应当办理申请批准等手续的当事人未履行义务的，对方可以请求其承担违反该义务的责任。依照法律、行政法规的规定，合同的变更、转让、解除等情形应当办理批准等手续的，适用前款规定。