核心结论：房贷少存1000元是否构成逾期，需结合贷款合同约定、银行扣款规则及实际补存时间综合判断。若已构成逾期，可通过及时补存、与银行沟通、保留证据等方式降低影响。以下是具体分析：

1. 是否构成逾期的判断标准

• 合同约定优先：首先需查看贷款合同中关于“逾期”的定义。通常合同会明确“未按约定金额或时间足额还款”即构成逾期，但部分银行可能对“部分逾期”有特殊条款（如允许短期宽限或补存后不视为违约）。
• 银行扣款规则：若合同未明确，需关注银行实际扣款情况。若银行在还款日当天因余额不足未全额扣款，即使次日补存，部分银行仍可能记录为“逾期一次”；若银行支持“部分扣款+后续补扣”，且在宽限期内补足，可能不视为逾期。
• 实际影响：即使构成逾期，若仅一次且金额较小，通常不会立即影响征信，但可能产生罚息（合同约定的逾期利率计算）。

2. 若已构成逾期，如何补救？

• 立即补存差额：发现少存后，第一时间将1000元存入还款账户，确保银行后续扣款成功。
• 联系银行说明情况：主动致电银行客服，说明因疏忽导致少存，询问是否已记录逾期、是否可撤销或修改记录。部分银行对首次、小额逾期可能酌情处理。
• 保留沟通记录：若银行承诺不记录逾期或调整罚息，要求客服通过短信或邮件确认，避免后续纠纷。
• 关注征信报告：逾期记录可能滞后上传至征信系统，建议次月查询个人征信报告，确认无异常记录。若发现错误，可向银行或征信机构提出异议申请。

3. 长期预防措施

• 设置还款提醒：通过手机日历、银行APP提醒等功能，提前3-5天确认还款金额及账户余额。
• 开通自动扣款：若银行支持，可绑定储蓄卡开通自动扣款，避免手动操作遗漏。
• 预留充足余额：还款日前1日确保账户余额≥当期还款额+1000元（预留缓冲空间）。

提示：若银行已记录逾期且拒绝调整，或因此产生高额罚息，可进一步提供合同条款、沟通记录等材料，我将协助分析是否存在不合理条款或银行过错，维护您的合法权益。