结论：借条写两年还清，过了三年后，借条本身仍然有效，但债权人在通过法律途径主张债权时，需特别注意诉讼时效的相关规定。若未超过诉讼时效或存在诉讼时效中断、中止的情形，债权人仍有权要求债务人还款；若已超过诉讼时效且未发生中断或中止，债权人可能丧失胜诉权。
详细分析：
借条的法律效力：
- 借条作为证明借贷关系存在的重要书面证据，其法律效力不因时间的推移而自动消失。只要借条内容合法、真实，且基于双方的真实意思表示签订，即具有法律效力。
诉讼时效的规定：
- 根据《中华人民共和国民法典》第一百八十八条，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间通常为三年。对于约定了还款日期的借条，诉讼时效从还款日期届满之日起开始计算。因此，若借条上写明两年还清，那么诉讼时效从两年期满之日起开始计算三年。
诉讼时效的起算与影响：
- 在上述案例中，若还款日期至今已超过三年（即从借条写明的还款日期起算已超过五年，但诉讼时效从两年期满后起算已超过三年），且期间未发生诉讼时效中止或中断的情形，债务人可以提出不履行义务的抗辩，债权人可能因此丧失胜诉权。
诉讼时效的中止与中断：
- 诉讼时效中断：根据《民法典》第一百九十五条，若债权人在诉讼时效期间内以书面催款函、短信、微信等方式向债务人主张权利，或者债务人同意履行还款义务，诉讼时效将中断。从中断时起，诉讼时效期间重新计算三年。例如，若债权人在还款日期届满后的两年内曾多次催讨借款，并能提供相关证据，则每一次催讨都可能导致诉讼时效中断。
- 诉讼时效中止：根据《民法典》第一百九十四条，在诉讼时效期间的最后六个月内，如因不可抗力等法定事由导致债权人无法行使请求权，诉讼时效将中止。自中止时效的原因消除之日起满六个月，诉讼时效期间届满。
实际操作建议：
- 收集证据：债权人应尽可能收集并保存与借贷关系相关的所有证据，如借条、转账记录、聊天记录等，以证明借贷关系的存在及诉讼时效的中断或中止。
- 及时主张权利：债权人应密切关注诉讼时效的进展，确保在有效期内主张权利。若面临诉讼时效问题，可尝试与债务人协商达成新的还款协议或让债务人出具新的还款计划，以重新计算诉讼时效。
- 法律途径：若债务人拒绝还款且诉讼时效即将届满或已届满，债权人可考虑通过法律途径解决纠纷。在提起诉讼前，建议咨询专业律师（即我本人）以制定合适的法律策略。
法律后果：
- 若债权人未在诉讼时效期间内主张权利，且未发生诉讼时效中断或中止的情形，债务人可以提出不履行义务的抗辩，债权人可能因此丧失胜诉权。这意味着，即使债权人持有有效的借条，法院也可能因诉讼时效已过而不支持其诉讼请求。
总结与建议：
借条作为债权债务关系的证明文件，其法律效力不受时间限制。但在实际操作中，债权人需特别注意诉讼时效的相关规定及可能影响。为确保自身权益得到有效保护，建议债权人在面临诉讼时效问题时及时咨询并向我提问，我将根据具体情况提供针对性的法律建议。