结论前置：双方协议离婚后，如果发现对方在婚姻关系存续期间存在重婚行为，且该行为未超过追诉时效，你确实可以追究另一方的重婚罪。
法律依据与追诉时效
根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，重婚罪是指有配偶而重婚的，或者明知他人有配偶而与之结婚的行为，其法定最高刑为二年有期徒刑。因此，重婚罪的追诉时效为五年，即从犯罪之日起计算（若犯罪行为有连续或继续状态，则从犯罪行为终了之日起计算），在五年内可以依法追究对方的刑事责任。
追究重婚罪的条件
重婚行为发生在婚姻关系存续期间：
- 这是追究重婚罪的基本前提。只要重婚行为发生在你们合法的婚姻关系存续期间，即使后来双方已经协议离婚，你仍有权追究对方的重婚罪责任。因为重婚行为已经对婚姻关系造成了严重的侵害，这种侵害行为的法律责任不会因婚姻关系的结束而消失。
在追诉时效内：
- 如前所述，重婚罪的追诉时效为五年。你需要确保在发现对方重婚行为后的五年内提起诉讼或报案，否则可能会因超过时效而丧失追究对方刑事责任的权利。当然，如果之前并不知情，从发现之日起算五年内也是可以的。
有确凿的证据：
- 证据是追究重婚罪的关键。你需要收集能够证明对方重婚行为的证据，如结婚证（如果对方与他人再次登记结婚）、孩子出生证（如果对方与他人有子女且以夫妻名义共同生活）、同居生活的照片或视频、证人证言、聊天记录等。这些证据应当具有合法性、真实性和关联性，以确保其法律效力。
追究重婚罪的方式
刑事自诉：
- 你可以直接向人民法院提起刑事自诉，要求追究对方的刑事责任。在提起自诉时，你需要提交刑事自诉状和相关证据材料。法院将依法审理案件，并根据事实和法律规定作出判决。
公诉（特殊情况）：
- 在一般情况下，重婚罪属于自诉案件。但如果重婚行为情节严重、影响恶劣，或者你因受强制、威吓等原因无法告诉的，人民检察院也可以提起公诉。不过，这种情况相对较少见。
实际操作建议
及时收集证据：
- 一旦发现对方可能存在重婚行为，应立即开始收集证据。证据的收集要尽可能全面、细致，以确保在提起诉讼或报案时能够提供有力的支持。
咨询法律意见：
- 在准备追究对方重婚罪之前，建议你向我咨询法律意见。我可以根据你的具体情况和收集到的证据，为你提供专业的法律分析和建议，帮助你更好地维护自己的合法权益。
关注追诉时效：
- 要密切关注追诉时效问题，确保在法定的追诉时效内提起诉讼或报案。如果因故无法及时提起诉讼或报案，应尽快采取措施保留相关证据和线索，以便在追诉时效内继续追究对方的刑事责任。
示例说明
假设你和对方在婚姻关系存续期间，对方与他人以夫妻名义共同生活并登记结婚。后来你们协议离婚，但你在离婚后发现了对方的重婚行为。只要你能够提供确凿的证据证明对方的重婚行为，并且自重婚行为终了之日起未超过五年，你就有权向法院提起刑事自诉或向公安机关报案，追究对方的重婚罪。
综上所述，双方协议离婚后仍然可以追究另一方的重婚罪，但前提是你要能够提供充分的证据来证明对方的重婚行为，并且未超过追诉时效。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。