支票上的法人章扣反了，一般情况下，该支票仍然有效，但建议尽快重新加盖正确的法人章以确保支票的顺利兑现。以下是从不同角度对此问题的详细分析：

1. 支票的有效性：

   • 支票的有效性主要取决于其是否符合《中华人民共和国票据法》等相关法律法规的规定，包括支票的格式、内容、签章等。法人章扣反了，并不直接导致支票无效，因为这并不改变支票的基本内容和格式，也不影响支票上其他必要签章的有效性。
   • 然而，如果法人章扣反了导致支票上的签章不清晰或难以辨认，可能会影响支票的兑现。银行在处理支票时，需要核对支票上的签章与预留印鉴是否一致，如果签章不清晰，银行可能会拒绝兑现或要求进一步核实。

2. 实际操作建议：

   • 尽快重新加盖：如果发现法人章扣反了，建议尽快在支票上重新加盖正确的法人章，以确保支票的签章清晰、可辨认。这可以减少因签章问题导致的兑现延误或拒绝。
   • 与银行沟通：在重新加盖法人章之前或之后，可以与支票兑现的银行进行沟通，说明情况并询问银行的具体要求。银行可能会提供具体的指导或建议，以帮助顺利兑现支票。
   • 保留证据：如果因法人章扣反了导致支票兑现出现问题，建议保留相关证据，如支票复印件、银行拒绝兑现的通知等。这些证据可能在后续的法律纠纷或协商中起到重要作用。

3. 法律后果与风险防范：

   • 法律后果：如果因法人章扣反了导致支票无法兑现，且给持票人造成了损失，持票人可能会依据《中华人民共和国票据法》等相关法律法规向出票人（即加盖法人章的单位）追偿。因此，出票人应尽可能确保支票的签章正确、清晰。
   • 风险防范：为了避免因法人章扣反了等签章问题导致的法律风险，建议单位在加盖法人章时采取谨慎态度，确保签章的正确性和清晰度。同时，可以定期对预留印鉴进行核对和更新，以确保与银行记录的一致性。

总结与建议：支票上的法人章扣反了并不直接导致支票无效，但可能影响支票的兑现。为了确保支票的顺利兑现和避免法律风险，建议尽快重新加盖正确的法人章，并与银行进行沟通。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。