结论：在女方起诉离婚，男方不承认打入其卡里的钱是女方工资的情况下，女方可以通过收集相关证据来证明该款项的性质，进而在离婚诉讼中维护自己的合法权益。以下是从不同角度给出的详细分析和建议：
一、证据收集与证明
工资条或银行流水：
- 女方应首先尝试获取自己的工资条或银行流水记录，这些记录能够直接证明款项的来源和性质，即该款项是女方的工资收入。
- 如果工资条或银行流水记录显示款项是定期、定额地打入男方账户，且与女方的工资发放时间、金额相吻合，这将是非常有力的证据。
劳动合同或工作证明：
- 女方可以提供与用人单位签订的劳动合同或工作证明，以证明自己有稳定的收入来源，且该收入与打入男方账户的款项相关联。
证人证言：
- 如果有可能，女方可以寻找同事、朋友或家人作为证人，他们可以提供关于女方工资发放情况、款项打入男方账户的原因等证言，以支持女方的主张。
通讯记录或聊天记录：
- 如果女方与男方之间有关于工资发放、款项打入的通讯记录或聊天记录，这些也可以作为证据来证明款项的性质和用途。
二、法律分析与诉讼策略
夫妻共同财产的认定：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，夫妻在婚姻关系存续期间所得的工资、奖金、劳务报酬等属于夫妻共同财产。因此，如果女方能够证明打入男方账户的款项是其工资收入，那么该款项应被认定为夫妻共同财产。
诉讼策略的选择：
- 在离婚诉讼中，女方可以主张该款项是其个人财产（如果能够证明是婚前财产或个人专属财产）或夫妻共同财产（如果无法证明是个人财产），并要求法院进行分割。
- 如果男方否认该款项是女方的工资收入，女方需要承担举证责任，提供上述证据来支持自己的主张。
法院的裁判原则：
- 法院在审理离婚案件时，会根据双方提供的证据和法律规定来认定夫妻共同财产的范围和分割方式。如果女方能够提供充分的证据证明该款项是其工资收入，法院很可能会将其认定为夫妻共同财产并进行分割。
三、实际操作建议
及时咨询律师：
- 在面临离婚诉讼时，女方应及时咨询专业律师，了解自己的权利和义务，以及如何收集证据和制定诉讼策略。
保持冷静和理性：
- 离婚诉讼可能涉及复杂的法律问题和情感纠葛，女方应保持冷静和理性，避免情绪化决策或行为。
积极配合法院审理：
- 在诉讼过程中，女方应积极配合法院的审理工作，提供必要的证据和资料，以便法院能够公正、公平地处理案件。
最后，如果女方在收集证据或制定诉讼策略方面遇到困难，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供专业的法律建议和帮助。