结论：农村的自然路被人开垦种地是否违法，需根据具体情况判断，主要包括是否改变土地用途、是否获得合法审批以及是否侵犯他人权益等几个方面。
分析说明：
改变土地用途：
- 自然路通常属于农村公共道路或集体用地，其用途是供村民通行。如果未经许可将自然路开垦为耕地，改变了土地的原有用途，这可能违反了《土地管理法》中关于土地用途管制的规定。根据该法，任何单位和个人不得擅自改变土地用途，必须依法办理相关审批手续。
合法审批：
- 如果想要在自然路上进行开垦种地，必须事先获得相关部门的审批。这通常涉及到土地管理、农业、林业等多个部门的联合审批。未经审批擅自开垦，属于违法行为，可能会受到行政处罚，甚至面临刑事责任。
侵犯他人权益：
- 自然路作为农村公共设施，其使用权益属于全体村民。如果个人擅自开垦种地，可能侵犯了其他村民的通行权或其他合法权益。在这种情况下，受害村民有权要求停止侵害、恢复原状，并可能要求赔偿损失。
特殊场景：
- 如果自然路长期无人使用，且开垦行为未对他人造成实质性影响，同时获得了村委会或相关部门的默许或事后追认，那么这种行为可能不会被视为违法。但这种情况较为特殊，且存在法律风险，不建议轻易尝试。
后续行动建议：
- 如果您或他人计划在农村自然路上进行开垦种地，建议先咨询当地土地管理部门或村委会，了解相关政策和审批流程。
- 如果已经发生了未经审批的开垦行为，建议尽快与相关部门沟通，补办审批手续或恢复土地原状，以避免法律纠纷和处罚。
法律背景：
- 《土地管理法》第四条规定：“国家实行土地用途管制制度。国家编制土地利用总体规划，规定土地用途，将土地分为农用地、建设用地和未利用地。严格限制农用地转为建设用地，控制建设用地总量，对耕地实行特殊保护。”
- 《土地管理法》第七十七条规定：“未经批准或者采取欺骗手段骗取批准，非法占用土地的，由县级以上人民政府自然资源主管部门责令退还非法占用的土地，对违反土地利用总体规划擅自将农用地改为建设用地的，限期拆除在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施，恢复土地原状，对符合土地利用总体规划的，没收在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施，可以并处罚款；对非法占用土地单位的直接负责的主管人员和其他直接责任人员，依法给予处分；构成犯罪的，依法追究刑事责任。”
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