在案件复议期间向法院起诉，其影响主要取决于复议与诉讼的关系类型以及起诉的具体时机和内容，以下分情况讨论：
复议前置情形下的影响
- 法律效果：在复议前置的案件中，如纳税争议等，行政相对人必须先申请行政复议，对复议结果不服的才能向法院起诉。若在此期间未经复议直接起诉，法院将不予受理。
- 程序衔接：若已申请复议且复议机关已受理，在复议期间又向法院起诉的，法院通常不会受理，因为复议程序尚未终结，行政争议尚未最终确定。
复议与诉讼选择情形下的影响
- 选择权行使：在复议与诉讼可选择的案件中，行政相对人可以选择申请复议或直接向法院起诉。若选择复议后，在复议期间又向法院起诉，这通常被视为对复议程序的不尊重，且可能因程序冲突而被法院驳回。
- 程序冲突解决：若行政相对人坚持在复议期间起诉，法院可能会要求其撤回复议申请或中止诉讼程序，待复议程序终结后再恢复诉讼。这可能导致诉讼程序的延误和成本的增加。
复议期间对原行政行为起诉的影响
- 原行政行为效力：在复议期间，原行政行为通常不停止执行，但法律另有规定的除外。若行政相对人在此期间对原行政行为提起诉讼，法院将审查原行政行为的合法性。
- 诉讼与复议结果关系：若法院在复议期间对原行政行为作出了判决，且该判决与复议机关后续作出的复议决定不一致，这可能导致行政争议的复杂化。通常，复议机关会尊重法院的判决，但这也可能引发对复议机关独立性的讨论。
复议机关作为被告的情形
- 被告确定：若复议机关改变了原行政行为，行政相对人对复议决定不服提起诉讼的，复议机关将成为被告。此时，原行政行为的作出机关将作为第三人参加诉讼。
- 诉讼焦点：在复议机关作为被告的诉讼中，法院将重点审查复议决定的合法性，包括复议程序是否合法、复议决定是否基于充分的事实和法律依据等。
法律建议：
- 谨慎选择救济途径：行政相对人在面临行政争议时，应仔细分析案件性质，选择合适的救济途径。若案件属于复议前置情形，则必须先申请复议；若案件属于复议与诉讼可选择情形，则应根据案件具体情况和自身需求选择最合适的途径。
- 尊重程序规定：在复议或诉讼过程中，行政相对人应严格遵守程序规定，避免在复议期间擅自向法院起诉或采取其他可能干扰程序正常进行的行为。
- 及时咨询专业律师：由于行政复议和行政诉讼涉及复杂的法律问题和程序规定，行政相对人在面临行政争议时应及时咨询专业律师，以获取专业的法律意见和帮助。
可能后果：
- 若行政相对人在复议期间擅自向法院起诉，可能导致法院不予受理或驳回起诉，从而浪费时间和精力。
- 若复议机关或法院因行政相对人的不当行为而对其产生不利印象，可能影响复议或诉讼的结果。
- 在极端情况下，行政相对人的不当行为可能构成妨碍诉讼或复议的行为，从而面临法律责任。